研究項目
秦樹輝先後主持完成內蒙古師範大學教學研究項目“民俗地理學教學體系及內容的探索研究（ 1997 -1999 ），1996 年獲內蒙古師範大學優秀教學成果一等獎和內蒙古自治區優秀教學成果二等獎。在科研方面，主持完成了自治區自然科學基金項目“內蒙古錫林郭勒草原人地關係的生態系列研究（ 1997 一 1999 ） “西桌子山珍稀植物群生態系列及生態支撐條件的研究“（ 1996 一1998 ），參加完成了國家級科研項目 3 項，其中主要有國家科委項目“國土資源衛星在京津唐國土資源調查中的套用研究”（ 1986 一 1987 ），國家自然科學基金重點項目子課題“中條山植物種類多樣性研究“（ 1986 一 1987 ），國家自然科學基金項目“烏蘭布和沙漠全新世沉積記錄及其環境變遷意義”（ 1998 一 2000 ），參加自治區級科研項目 3 項，其中主要有自然科學基金項目“遙感技術在呼和浩特市城市規劃建設與環境調查中的套用研究（ 1 988 一 1992 ），內蒙古自然科學基金項目“歷史時期烏蘭布和沙漠環境演變與綠洲生態系統穩定性的研究“（ 1 996 一 1998 ）；還參加校級科研項目和橫向科研課題 7 項。目前主持和參加的科研項目主要有：主持自治區自然科學基金“呼和浩特市城市景觀適宜性評價研究”，參加國家社會科學基金項目“內蒙古城市化與生態安全研究”、國家自然科學基金項目“農牧交錯帶產業結構演進與城市化的互動機理研究”和“內蒙古草原蝗災遙感監測機理與方法研究”、內蒙古自然科學基金重點項目“內蒙古城市化過程與生態環境相互作用機制研究”。
科研獎勵
科研項目
1、1986-1987年參加國家科委“國土資源衛星在京津唐國土資源調查中的套用研究”項目的工作。
2、1987年參加國家自然科學基金重點項目子課題“中條山植物種類多樣性研究”的研究工作。
3、1988-1992年內蒙古自治區自然科學基金項目“遙感技術在呼和浩特市城市規劃建設與環境調查中的套用研究”的主要完成人。
4、內蒙古自然科學基金項目(項目編號980202)"內蒙古錫林郭勒草原人地關係的生態系列研究" [主持人]
5、內蒙古社會科學規劃項目(項目編號9808) "內蒙古自治區高等學校科技成果向現實生產力轉化的研究" [主持人]
6、內蒙古教育廳科研項目(項目編號A97039) "內蒙古西桌子山珍稀植物群生態系列及生態支撐條件的研究" [主持人]
7、內蒙古師大教學研究項目“民俗地理學教學體系及內容的探索研究”[主持人]
8、國家自然科學基金項目(項目編號49861006) "烏蘭布和沙漠全新世沉積記錄及其環境變遷意義"[第二成員]
9、內蒙古自然科學基金項目(項目編號94-03-31)"歷史時期以來烏蘭布和沙漠環境演變與綠洲生態系統穩定性研究" [第五完成人]
10內蒙古師大青年科研基金重點項目（項目編號：QNZ9906 ）“內蒙古師範大學科研管理信息系統”（主要成員）
11、內蒙古自然科學基金項目“呼和浩特市城市景觀適宜性評價研究”(項目編號200308020506)[主持人]
12、國家社會科學基金項目“內蒙古城市化與生態安全研究”[第三參加人]
13、國家自然科學基金項目“農牧交錯帶產業結構演進與城市化的互動機理研究”[第三參加人]
14、內蒙古自然科學基金項目“內蒙古城市化過程與生態環境相互作用機制研究” [第三參加人]
15、國家自然科學基金項目(項目編號40561010) “內蒙古草原蝗災遙感監測機理與方法研究” [參加人]
16、內蒙古教育廳科研項目：內蒙古種子植物區系管理信息系統預研究（項目編號Jzc08035）[主持人]
17、內蒙古師大科研基金：內蒙古種子植物計算機輔助識別系統研究[主持人]
18、國際合作科研項目：查乾諾爾乾湖盆鹼蓬栽培的生態學分析[主持人]
19、國際合作科研項目：查乾諾爾湖景觀類型動態變化分析[主持人]
主要論文論著
1、秦樹輝：華山北坡的植被及其垂直分布，《內蒙古師大學報》,1989(3)
2、王維珍，秦樹輝等：呼和浩特市城市垃圾資源的遙感套用研究，《乾旱區資源與環境》，1990-3期
3、秦樹輝,等：彩紅外航片在編制呼和浩特地區植被資源圖中的套用研究，《遙感技術在呼和浩特市城市規劃建設與環境調查中的套用研究》，內蒙古人民出版社，1992年
4、秦樹輝,等：彩紅外航片在呼和浩特市綠地調查中的套用，《遙感技術在呼和浩特市城市規劃建設與環境調查中的套用研究》，內蒙古人民出版社，1992年.
5、秦樹輝,等：彩紅外航片在呼和浩特市大中專院校用地的調查套用研究,《遙感技術在呼和浩特市城市規劃建設與環境調查中的套用研究》，內蒙古人民出版社，1992年
6、秦樹輝,等：遙感技術在呼市城市垃圾資源化中的套用研究，《遙感技術在呼和浩特市城市規劃建設與環境調查中的套用研究》，內蒙古人民出版社，1992年.
7、秦樹輝,等：彩紅外航片在呼市建築物密度調查中的套用，《遙感技術在呼和浩特市城市規劃建設與環境調查中的套用研究》，內蒙古人民出版社，1992年
8、張秋亮，秦樹輝等：遙感技術在呼市中國小用地及操場用地的研究，《遙感技術在呼和浩特市城市規劃建設與環境調查中的套用研究》，內蒙古人民出版社，1992年.
9、秦樹輝，郝潤梅，張衛青等：呼和浩特市城區交通道路高峰期人車流量的調查分析研究，《內蒙古師大學報》（自然漢版），1994.(地理學增刊)
10、賈鐵飛，寶音，秦樹輝：內蒙古資源環境與區域開發研究的回顧與展望，內蒙古師大學報（自然漢版），1994.(地理學增刊)
11、郝潤梅，賽西雅拉圖，秦樹輝：五台山植被分布現狀淺議，《內蒙古師大學報》（自然漢版）1994.(地理學增刊)
12、銀山，雷軍，賈鐵飛，秦樹輝：呼和浩特市城市環境問題及綜合整治對策研究《內蒙古自治區科學技術協會首屆青年學術年會論文集》1996年
13、秦樹輝：談內蒙古中部地區蒙古族牧民生產生活中的繫結習俗，《內蒙古師大學報》（哲社漢版）1997.5期
14、海春興，秦樹輝，蘇惠民：內蒙古河套地區農業開發與環境變化的關係分析，內蒙古師大學報（哲社漢版）1997.6期
15、秦樹輝等：人類活動因素在我國洪水成災中的作用及防治對策，《內蒙古經濟與科技》1998-增刊，
16、秦樹輝，張玉峰，韓秀珍：呼和浩特市城郊結合部典型地段土地利用變更分析研究《內蒙古師大學報》（自然漢版）1998.3期
17、秦樹輝，韓秀珍：初探自然地理環境對民俗事象的影響，《內蒙古師大學報》（哲社漢版）1998.5期
18、寶音，李文，蘇根成，呼格吉勒圖，秦樹輝，包玉海：科爾沁右翼前旗土地利用結構特徵及區域差異，《內蒙古師大學報》（自然漢版）1998.3期
19、秦樹輝等：內蒙古西桌子山珍稀植物群分布區新生代以前生態條件歷史演變的研究，《內蒙古師大學報》，1999-6期，
20、秦樹輝等：內蒙古西桌子山新生代自然生態環境演變研究，《面向二十一世紀的科技進步與社會經濟發展》，中國科學技術出版社，1999年
21、秦樹輝等：內蒙古西桌子山及其鄰近地區珍稀植物群分布現狀研究，《乾旱區資源與環境》，1999-增刊
22、秦樹輝：強化城市綜合管理，建設城市生態旅遊景觀的探討，《乾旱區資源與環境》，1999-增刊
23、何雨,秦樹輝,賈鐵飛：烏蘭布和沙漠東北部綠洲農業的資源環境條件與可持續發展《內蒙古師大學報》（自然科學漢文版）1999年3月第28卷第1期
24、郝潤梅,秦樹輝等：呼和浩特市景觀生態環境分析，《乾旱區資源與環境》，1999-增刊
25、賽西雅拉圖，秦樹輝等：內蒙古阿巴嘎旗近期牧用草地資源荒漠化環境評價《乾旱區資源與環境》，1999-增刊
26、秦樹輝等：內蒙古生態環境建設與可持續發展，《人文地理》，2000-5期
27、秦樹輝等：內蒙古西桌子山新生代以來自然生態環境演變的研究，《內蒙古師大學報》，2000-4期
28、海春興，秦樹輝等：內蒙古托克托縣沿黃區生態環境特點、存在問題及治理的意義，《中國高校教育與科研》，中國社會科學出版社，2000-3期
29、海春興，吳紅英，秦樹輝：內蒙土默特沖積平原土壤鹽鹼化過程及改造途徑研究——以托縣永聖域鄉為例，《內蒙古科技與經濟》，2000-6期
30、郝潤梅，賽西雅拉圖，秦樹輝等，內蒙古草原牧區冬營地對草場退化的影響，中國草地，2000-6期
31、Qin Shuhui ：A characteristic alteration study of community quantity and quality in the Inner Mongolia plateau typical steppe.Biodiversity of the Mongolia Plateau and Adjacent Territory,2001 August,ISBN 99929-5-378-0
32、寧小莉，秦樹輝：地貌條件對民俗事象的影響，《陰山學刊》（自然科學版），2001-5期
33、寧小莉、秦樹輝：水文因素對民俗事象的影響，《陰山學刊》（自然科學版），2001-6期
34、秦樹輝等：內蒙古正藍旗旅遊業發展基礎與發展對策，《經濟地理》2002增刊
35、韓秀珍，布和敖斯爾，秦樹輝等：利用衛星ETM與樣方統計數據研究西鄂爾多斯珍稀瀕危植物種群分布規律，《遙感學報》2003-2期
36、秦樹輝、寧小莉：淺談氣候因素對民俗事象的影響，《內蒙古師範大學學報》（哲學社會科學版）2003年05期
37、寧曉麗，秦樹輝，包玉海：城市生態支持系統研究綜述，陰山學刊，2004：第18卷第1期
38、王玉梅，秦樹輝等：呼和浩特城市景觀生態格局分析，《乾旱區資源與環境》，2004：第18卷，第2期，
39、寧曉莉,秦樹輝等：包頭市城市生態支持系統可持續發展的限制因子探討，《人文地理》2005-6期
40、寧小莉，秦樹輝，包玉海：包頭市城市生態支持系統可持續發展對策研究，內蒙古師範大學學報(自然科學漢文版)，2005：第34 卷第4 期
41、Qin Shu-hui,Sun Zhi-fen：The study of the urban inhabitant scenic environment suitable evaluation of Hohhot，《Natural Resources and Sustainable Development in Surrounding of the Mongolian Plateau 》，2006
42、郭永昌，張敏，秦樹輝：包頭市城市地域空間擴展的動力機制研究，乾旱區資源與環境，2006：第20卷第5期
43、秦樹輝,李雙權,寧小莉：呼和浩特市主城區邊緣地帶景觀動態變化抽樣研究，陰山學刊，2006：第20卷第3期
44、孫志芬, 秦樹輝：呼和浩特市城市經濟發展動態評價研究，內蒙古師範大學學報(自然科學漢文版)，2007：第36 卷第1 期
45、王牧蘭, 包玉海, 阿拉騰圖雅, 秦樹輝：渾善達克沙地景觀格局變化研究，乾旱區資源與環境，2007：第21卷第5期
46、甄江紅, 蘇根成, 秦樹輝：近三十年來四合木分布區景觀格局變化及其對生態安全的影響，內蒙古師範大學學報(自然科學漢文版)，2009：第38 卷第1 期
47秦樹輝，謝麗麗，包山虎：內蒙古種子植物區系地理特徵及其與相鄰地區差異性分析，《The Sixth International Conference on Natural Resources and Sustainable Development in surrounding Regions of the Mongolia plateau》論文集，2009
48謝麗麗，包山虎，秦樹輝：內蒙古種子植物信息管理系統的設計與構建，《The Sixth International Conference on Natural Resources and Sustainable Development in surrounding Regions of the Mongolia plateau》論文集，2009
49、寶音，秦樹輝等：內蒙古資源大辭典（旅遊資源分冊）（編委）內蒙古人民出版社1997年
50、秦樹輝等：呼和浩特市城市環境綜合整治規劃 （研究報告，第一編寫人） 1995.6.
51、毛昭暉，秦樹輝等：涼城縣旅遊資源開發建設項目可行性研究報告 （研究報告，技術負責人）1997.3
52、毛昭暉，秦樹輝等：涼城縣旅遊發展總體規劃（研究報告，第二完成人）1997.5.
獲獎及榮譽稱號
A、教學獲獎
1.1996年獲內蒙古師範大學優秀教學成果一等獎
2.1997年獲普通高等學校自治區級優秀教學成果二等獎
B、科研獲獎
3.1993年獲國家建設部科技進步三等獎
4.1993年獲呼和浩特市科技進步一等獎(附獎勵公報)
5.1994年獲內蒙古師範大學科研成果一等獎
6.1996年獲國家土地局優秀成果二等獎
7.1996年獲內蒙古師範大學科研成果二等獎
8.1996年獲內蒙古師範大學科研成果三等獎
9.1996年獲自治區哲學社會科學優秀成果二等獎
10.1997年獲第一次全國資源工程學術研討會優秀論文一等獎
11.1998年2月27日獲內蒙古土地局科技進步二等獎
12.1998年2月27日獲內蒙古土地局科技進步二等獎(另項)
13.1998年9月1日獲內蒙古師範大學社會科學三等獎
14.1998年9月1日獲內蒙古師範大學社會科學三等獎(另項)
15.2000年獲自治區哲學社會科學優秀成果三等獎
科研鑑定
1、內蒙古師範大學科研管理信息系統，內蒙古師範大學青年科研基金重點項目（項目編號:QNA9906，第二成員），2000年通過自治區級鑑定
2、自治區高等學校科技成果向現實生產力轉化的研究，自治區社會科學規劃項目，（項目主持人，執筆）2001年通過自治區級鑑定
