職能調整
（一）將市安全生產委員會辦公室職能交市安全生產監督管理局。（二）將市外事辦公室職能交市政府外事僑務辦公室
（三）增加支援前線和雙擁工作的組織協調職能。
（四）增加愛國衛生運動的組織協調職能。
主要職責
根據以上職能調整，市政府辦公室的主要職責是：（一）檢查、督促市政府各部門和各鎮（街）人民政府（辦事處）對市政府檔案、市政府會議決定事項及國務院、省政府、福州市政府、福清市政府領導重要批示，全國、省、福州市人大、政協以及福清市人大、政協交辦的建議、提案的貫徹執行和處理落實情況，並向市政府領導報告。
（二）負責市政府會議的準備工作和重要活動安排，協助市政府領導組織會議決定事項的實施。
（三）協助市政府領導審核或組織起草以市政府和市政府辦公室名義發布的文、函、電，辦理中央、國務院、省委、省政府和福州市委、市政府以及市省直各部、委、廳、局、辦傳送市政府的文、函、電。 （四）辦理各鎮（街）人民政府（辦事處）及市政府各部門向市政府的請示、報告，提出審核、處理意見，報市政府領導審批。
（五）根據市政府領導指示，組織協調市政府有關部門與省、福州市駐融單位、駐軍等關係，處理工作中出現的問題，對有爭議的問題提出處理意見，報市政府領導決定。
（六）協助市政府領導組織處理需由市政府直接處理的突發事件和重大事故。
（七）根據市政府領導的指示，組織有關調查研究，及時反映情況，提出建議，為市政府領導決策服務。
（八）負責市政府值班工作，及時向市政府領導報告重要情況，並協助處理各部門和鎮（街）向市政府反映的重要問題。
（九）收集、編輯報送市領導參閱的信息資料；負責全市政府系統辦公室主任培訓教育和辦公自動化網路建設工作。指導鎮（街）政府（辦事處）辦公室工作，促進全市政府系統行政效能建設。
（十）做好行政事務工作，為市政府領導及機關工作人員服務。
（十一）組織協調愛國衛生運動、支援前線和雙擁工作。
（十二）管理市機關事務管理局，為主管理市委、市政府信訪局。
（十三）辦理市委、市政府領導交辦的其他事項。
內設機構
（一）秘書科1、承辦或配合有關單位做好市政府或以市政府名義召開的各種會議的會務工作；
2、負責市政府領導有關活動的協調、組織工作。
3、負責市政府及辦公室的來文來電處理。
4、負責市政府及市政府辦公室檔案的覆核、協調、呈批、制發、管理。
5、負責市政府領導、市政府辦公室的行政事務和後勤服務工作。
6、負責市政府一周安排的收集匯總。
7、負責各類檔案、報刊的收發、傳遞、清退、歸檔和各類文稿的列印、文書檔案的管理。
8、負責市政府、市政府辦公室印章的管理。
9、負責市政府值班室管理，搞好安全保衛工作。 （二）綜合科
1、負責市政府重要檔案和重大報告的起草修改。
2、編寫全市經濟和社會發展情況報告及市情介紹材料。3、根據市政府領導的指示，組織重大課題的調查研究，撰寫調查報告。4、負責市政府重大會議領導發言材料的撰寫、修改。5、協助辦理日常政府接待、會務等事務性工作。
（三）督查科（市政府督查室，副科級）
1、檢查、督促市政府各項決議、決定，重要工作部署和上級領導，市委、市政府領導重要批示的貫徹執行情況，做好反饋工作。
2、負責省、福州市和福清市人大代表建議、政協提案的
督辦工作。
3、聯繫市政府主要領導，負責上傳下達、值班等服務工作。
4、負責市政府常務會議、市長辦公會議的議題收集等會務工作。
5、負責對全市政府系統督查工作進行業務指導。
（四）信息科
1、為本級政府提供及時、準確、全面的信息，並對蒐集的信息進行綜合分析和預測，為領導決策參考服務。定期編髮《福清要訊》正刊、領導參閱版和《福清政務》等信息內刊。
2、向省政府、福州市政府傳送上級領導所需要的各種信息，反映本市政府的各項中心工作及執行上級決策的情況及存在的問題。
3、負責上級政府系統重大信息的反饋工作，不定期地組織報送國辦、省辦所指定的專門信息及調研信息。
4、負責本市各級各類政務信息組織的協調、指導和聯絡工作，同時加強與外地建立橫向信息聯繫。
（五）法制科
1、審核以市政府名義制定的規範性檔案。
2、為市政府領導提供法律、政策依據和參與重大疑難行政案件的處理。
3、指導、監督、檢查各鎮（街）政府（辦事處）及市直各職能部門的行政執法。
4、開展法制宣傳，組織、指導行政執法隊伍的業務培訓。
5、辦理市政府領導交辦的有關政府法制工作事項。
（六）行政複議科
1、審查複議申請是否符合法定條件；向爭議雙方、有關單位及有關人員調查取證。
2、組織審理複議案件，擬定複議決定。
3、受複議機構法定代表人委託出庭應訴。
4、法律和法規規定的其他職責。
