位置
該站位於北京市東城區崇文門外大街（南北向）和珠市口東大街-廣渠門內大街（東西向）交匯處。5號線車站呈南北走向，7號線車站呈東西走向。兩線車站呈“T”型交叉。
結構
磁器口站站內立體圖（5號線）5號線車站為地下二層三拱兩柱結構，島式站台設計。地下一層為站廳層，地下二層為站台層。車站全長180米，寬21.87米，高14.933米。總建築面積12244.2平方米。主體結構採用暗挖中洞法施工，設有2座風道、4個出入口。該站與天壇東門站～磁器口站區間屬於5號線4標，由中鐵三局集團有限公司承建。
磁器口站圖片7號線車站為地下三層三跨三連拱結構，島式站台設計。地下一層為換乘廳，地下二層為站廳層，地下三層為站台層。車站總長233.6米，深度32.5米。採用暗挖法施工。屬於7號線4標，由中鐵十六局集團有限公司承建。
5號線車站在上，7號線車站在下。7號線換乘廳和5號線站廳層通過兩條換乘通道連線（7號線換乘廳與站廳通過樓梯和自動扶梯相連），通道長15米。在2014年11月16日至12月19日，5號線車站曾封站改造。
裝飾方面，5號線車站站廳層和站台層採用雙排白色立柱，站廳牆壁為紅色。7號線車站立柱為棕黃色。
圖冊參考資料
出入口
該站共有7個出入口：A（西北）、B（東北，未開通）、C（東南，未開通）、D（西南）、F1（東北）、G（東南）、H（西南）
| 出口編號 | 可前往目的地 |
| A | 珠市口東大街（北側）、新成文化大廈、寶島眼鏡、新陽商務樓、光明日報社 |
| B | 廣渠門內大街（北側）、普仁醫院、京文大廈 |
| C | 崇文門外大街（東側）、新裕家園 |
| D | 珠市口東大街（南側）、磁器口大街、萬商匯數碼城 |
| F1 | 廣渠門內大街（北側）、新景家園 |
| G | 廣渠門內大街（南側）、新裕商務大廈 |
| H | 廣渠門內大街（南側）、北京大都市大廈 |
| 注︰A口設有坡道和升降平台 ；F口設有坡道和直梯 | |
首末車時間
5號線
開往天通苑北：5:29-23:20
開往宋家莊：5:40-23:28
7號線
開往焦化廠：5:48-23:33
開往北京西站：5:35-22:50
周邊公交線路
A口
磁器口西：23、57、特7、夜7、夜10內
磁器口北：41、106、116、128、623、684、夜24、夜28
D口
磁器口西：23、57、夜7、夜10外
磁器口南：39、43、60、525
F1口
欖桿市：23、57、夜7、夜28
磁器口北：39、41、60、106、116、128、623、684、夜24、夜28
G口
欖桿市：23、57、夜7、夜28
H口
磁器口南：43路、525路
臨近車站
| 下行 | 線路 | 上行 |
| 開往宋家莊站 （下一站：天壇東門站） 距離1183米 | 5號線 | 開往天通苑北站 （下一站：崇文門站） 距離876米 |
| 開往北京西站 （下一站：橋灣站） 距離1016米 | 7號線 | 開往焦化廠站 （下一站：廣渠門內站） 距離1138米 |
