內部組織
核仁結構真核細胞細胞核內含核糖核酸(RNA)的結構，參與核糖體核糖核酸(rRNA)的合成和核糖體的形成。在光學顯微鏡下觀察，核仁一般為圓球形或卵球形的嗜鹼性結構，常處於細胞核內偏中心的位置。其大小因細胞類型和生理狀態不同而有很大差別。在蛋白質合成旺盛的細胞，通常核仁大，反之則體積小；前者如分泌細胞、神經元和腫瘤細胞等，後者如分裂球和肌細胞等。由於核糖體是細胞內蛋白質合成的場所，而核仁的功能又是合成rRNA，因此核仁常被稱為“核糖體工廠”。核仁所含RNA約占其乾重的5～10％，與蛋白質相結合形成核糖核蛋白(RNP)。此外還含有少量DNA，主要存在於核仁相隨染色質部分。亞顯微結構
rRNA的轉錄很多類型細胞的核仁是由核仁絲組成的網織狀結構，其中空隙填充著無定型基質。在電子顯微鏡下觀察，核仁絲是由緊密交織的、5納米的纖絲所組成，其間散在著15～20納米直徑的緻密顆粒。核仁區周緣的一部分圍繞著核仁相隨染色質。核仁相隨染色質是異染色質，但其中一部分以襻的形式伸展到核仁內部的是常染色質。以上三種成分所組成的三維結構，即使在同一個細胞中也會因其生理狀態不同而發生改變。許多證據表明，核仁纖絲含有顆粒成分的前體。例如，用放射自顯術結合生化分析的結果,表明為rRNA編碼的基因(rDNA)的最初產物(45S RNA)首先出現於纖絲成分，隨後在核仁內被加工，然後才能定位在顆粒成分。用電子顯微鏡三維重建技術發現許多細胞的核仁與核膜存在直接或間接的連線。間接連線包括與核膜的多種衍生結構，如環形片層、核芽、核通道和核內小管等的連線。上述現象特別易見於生長旺盛的細胞，因此可能有利於加速細胞質與核仁物質的交換。核仁組織區
細胞核的結構在細胞有絲分裂過程中，核仁出現周期性變化。一般在分裂前期逐漸消失，其纖絲和顆粒成分散失於核質之中；在分裂末期又重新出現。核仁的形成常與特定染色體的一定區域密切相關。在核仁消失後，這一區域就形成染色體上的次縊痕。次縊痕一般起著核仁組織區的作用。許多動、植物細胞只有一對這樣的染色體，稱為隨體染色體。但也有不少種類的細胞有幾對，甚至許多對這樣的染色體參與核仁形成，例如，人類細胞的第13、14、15、21和22對染色體上就都存在核仁組織區。實際上，核仁可被視為這些染色體的延伸，常表現很強的融合傾向，因此在許多有多對核仁染色體的細胞核里，常常只形成一個核仁。例如人淋巴母細胞在分裂前期，幾條核仁染色體都以其核仁組織區附著於同一個即將消失的核仁上。 核仁組織區存在rRNA的基因rDNA；在所有真核生物的細胞中，這種基因約有50～1000個相同拷貝，因而得以維持適當數量的rRNA的合成。真核細胞rDNA的每一個單位除含有轉錄區外，同時還有許多非轉錄區，稱為間隔順序，不同種屬、或同一種屬不同個體，甚至同一個體細胞的不同rRNA單位之間，這種間隔順序的長度往往差別很大。這種差別的意義及間隔順序的功能，現在還不清楚。
染色體外核仁
核糖體的組裝兩棲類卵母細胞發育早期階段（減數分裂前期的粗線期），rDNA大量複製，這一過程稱為基因擴增。這些新複製的rDNA並不與染色體相整合，而是以環形分子的形式存在於幾百個直到上千個染色體外核仁之中，為胚胎髮育過程中合成大量核糖體所需要的rRNA作準備。例如滑爪蟾的卵母細胞中的二價體染色體(4C)含12pgDNA〔單倍體(1C)基因組為3pg〕，而卵母細胞約含有30pgrDNA。因此，在擴增過程中產生了1～2×106額外的rRNA基因，存在於約1000個游離的核仁中。在爪蟾的一個卵母細胞核里，這些轉錄活躍的基因每秒鐘能產生約300000個rRNA前體分子，可是一個體細胞在相同時間卻只產生10～100個這種分子。 魚類、昆蟲和軟體動物的卵母細胞也都存在rRNA基因擴增現象，但以兩棲類卵母細胞最為明顯。此外，只有處於一個轉錄單位中的18S和28S兩種rRNA分子的基因進行基因擴增。多數真核細胞中核糖體的另一種結構成分5SRNA是由核仁外染色體基因編碼的。爪蟾5SRNA基因有兩類，一類在卵子發生中表達，另一類在體細胞內表達。體細胞5SDNA的拷貝數接近450，而卵母細胞則高達近24000。因此，在卵子發生過程中，5SRNA基因無需發生染色體外擴增的現象。
