簡介
生物三域理論是近代的生物分類理論。
三域理論發展
生物三域理論是由卡爾·沃斯（Carl Woese）在1977年提出的生物分類﹐將原核生物分成了兩大類﹐起初稱為真細菌(Eubacteria)和古細菌(Archaebacteria)。Woese依據16S rRNA序列上的差別﹐認為這兩組生物和真核生物從一個具有原始遺傳機制的共同祖先分別進化而來﹐因此將三者各劃為一類﹐作為比界高的分類系統，稱作“域”(Domain)或者“總界”(Superkingdom)。1990年，Carl Woese為了避免把古細菌也看作是細菌的一類，又把三域目前這三域改稱為細菌(Bacteria)﹑古生菌(Archaea)和真核生物(Eukarya)。
然而﹐RNA樹有可能將進化太快的類群放錯位置(比如微孢子蟲)。有人認為生物的根應該在真細菌之內﹐很多真細菌的類群在古細菌之前分支出來﹐很晚古細菌和真核生物才彼此分開。
三域特徵比較
特徵 細菌(Bacteria) 古菌(Archaea) 真核生物(Eukarya)
形態和遺傳原核細胞結構 是 是 否
共價閉合環狀DNA 是 是 否
組蛋白 無 有 有
被膜包圍的核 無 無 有
細胞壁 含胞壁酸 不含胞壁酸 不含胞壁酸
膜脂質 酯鍵連線 醚鍵連線 酯鍵連線
核糖體大小 70S 70S 80S
起始tRNA 甲醯蛋氨酸 蛋氨酸 蛋氨酸
多數基因中有內含子 否 否 是
操縱子 有 有 無
mRNA加帽和聚A尾 無 無 有
質粒 有 有 稀少
核糖體對白喉毒素敏感 否 是 是
RNA聚合酶 1 個（4亞基） 幾個(各8~12亞基） 3個（各12~14亞基）
需要轉錄因子 否 是 是
啟動子結構 -10和-35序列 TATA框 TATA框
產甲烷作用 無 有 無
硝化 有 無 無
脫氮 有 有 無
固氮 有 有 無
基於葉綠素的光合作用 有 無 有（在葉綠體中）
基於視紫紅質的能量代謝 有 有 無
化能無機營養（Fe, S, H2） 有 有 無
氣泡 有 有 無
聚-β-羥基脂肪酸作為碳儲存顆粒 有 有 無
在80℃以上生長 有 有 無
