(一) 辦公室
負責縣自然科研系列和局所屬單位工程技術系列職稱的評審推薦工作和專業技術人員的繼續教育和年度考核工作;參與科技副鄉鎮長的管理工作。
(二) 綜合計畫股
組織有關部門似定全縣科技發展中、長期規劃、組織編制、匯總全縣各類科技計畫;研究科技計畫管理辦法;對各級科技計畫的實施進行監督、協調、指導，掌握基本運行情況，負責科技綜合統計和統計分析工作;研究多渠道增加科技投入的政策措施，負責開闢科技經費渠道，籌措科技資金;負責編制歸口管理的科學事業費、科技三項經費、科技型中小企業技術創新轉化資金等有關費用的預、決算;推動科技經費的財務改革和財務會計制度的實施工作，對經費的使用管理進行監督，負責歸口單位科技財務和國有資產管理;負責歸口管理內部審計。統籌規劃，管理科技事業發展基本建設。
研究擬訂農業和農村科技發展，科技促進社會發展的方針和政策，負責編制管理實施縣年度農業科技攻關計畫、星火計畫以及醫藥衛生與環境治理等社會發展方面的科技攻關計畫;組織指導農業重大支柱產業的科技示範，負責可持續發展實驗區、農業科技園區、星火密集區等農業科技示範區報批和管理工作;組織協調有關部門開展科技興農、科技興海、科技扶貧及農科教結合工作。
(三) 科技管理股
研究提出全縣科技體制改革的政策、措施並組織實
施，管理全縣民營科技企業，提出民營科技發展規劃和有關政策法規，負責民營科技機構、科技企業的審核、報批及統計工作。負責組織全縣科技普及和科技宣傳工作，組織、協調開展科技考核。協助局領導抓好我縣與國內外高等院校科研院所開展科技合作工作，會同有關部門做好企業博士後流動站的申請和跟蹤服務工作，協調有關部門促進“產學研”合作。
管理、協調科技外事工作;組織實施國際及對港、澳、台科技合作與交流;編制和實施“科技興貿”計畫，承辦科技出國任務和人員報批;會同有關部門管理技術出口工作;負責“科技成果轉化法”、“專利法”、“契約法”中有關技術契約規定等科技法律法規的宣傳貫徹和檢查督促;研究提出促進全縣科技成果、專利、技術市場發展的政策、措施;歸口管理全縣科技成果、科技獎勵、技術市場、專利及與科技相關的智慧財產權保護(除著作權)等工作;參與專業人才管理工作。
研究制訂全縣工業領域高新技術發展及產業化的方針政策;組織提出全縣工業領域高新技術發展規劃和計畫;組織實施工業領域的重大科技攻關計畫及火炬計畫等重大高新技術產業化項目;負責全縣科技創新工程的組織實施;負責組織高新技術企業和高新技術產品的審核、報批工作及高新技術產業發展資金的籌措工作;負責組織申報和實施國家和省市工業領域科技攻關計畫、高新技術研究發展計畫、火炬計畫和新產品試製計畫;管理各類科技園區有關工作，協同有關金融部門組織編制並參與實施工業領域科技貸款，推動高新技術創業服務中心、科技綜合信息中心和生產力促進中心等技術服務體系的建設;負責科技型中小企業創新資金管理工作。負責管理全縣信息產業工作，研究擬定全縣電子信息產品製造業的發展戰略和總體規劃，推動國民經濟與社會服務信息化;根據產業政策與技術發展政策，引導與扶持信息產業的發展。
(四) 生產力促進中心
企業策劃服務部--企業工商稅務等註冊登記;提供項目設計、可行性論證，協助申報上級種類扶持資金項目;開展產學研相結合，提供技術項目對接平台;協助申報ISO、HACCP等有關質量管理體系認證。
信息技術開發部--網站建設和網頁設計;信息網路綜合布線，寬頻接入;辦公OA、企業ERP等軟體開發;計算機硬體、配件、辦公軟體及商務軟體銷售;音像製作。
中介諮詢服務部--科技信息、市場信息檢索;科技成果及專利技術申報代理;外文翻譯;科技產品展示;、勞務中介，代聘代請各種專業技術人員;證照代辦;代理各種轉讓、租賃、評估業務。
科技成果轉化推广部--提供科技成果與專利技術產業化孵化基地;科技成果及產品推廣銷售，農業高優品種苗木中介、推廣。
科技培訓部--開展科技培訓;電腦操作技能培訓;企業各種論證培訓;提供多媒體培訓教室。
(五) 科技綜合信息中心
負責科技情報資料收集管理、分析、發布利用，建立科技信息資料庫、科技項目庫，對本局文書檔案進行信息化管理，建立檔案資料庫;對本局電子信息網路進行維護，確保正常運作;參與“漳浦之窗”網站相關業務的管理，利用自身的技術和設備優勢，積極支持和參與全縣信息資源整合，把“漳浦之窗”綜合信息網建設成為能夠面向大眾，套用方便和技術強大、擴容能力強的中心信息網路服務平台。負責“漳浦科技、製造業信息化、星火計畫”網站的製作、管理和維護;承擔生產力促進中心有關信息技術服務職責，加快製造業信息化、農村科技信息化套用技術的推廣。
(六) 磁學套用技術研究所
加強磁學套用技術研究，退磁產品的開發。
