黃海海戰
漢納根1894年9月17日，黃海海戰爆發。漢納根與北洋水師提督丁汝昌在旗艦“定遠”指揮作戰。當北洋水師發現日本艦隊時，丁汝昌、漢納根指揮艦隊先以“犄角魚貫陣”迎敵。及見日本艦隊以“魚貫縱陣”逼來，並發現“日本艦隊似乎打算攻擊中國艦隊正中”的架式，乃下令變換陣形，“以鎮遠、定遠兩鐵甲艦居中，而張左右翼應之，令作犄角雁行陣”。午後1時許，海戰正式打響，戰鬥持續了5個小時。海戰結果，北洋水師損失軍艦5艘，死傷官兵800餘人。日本艦隊也遭到重創。海戰結束後，10月9日，清廷特頒諭旨，以“洋員漢納根在海軍當差，教練有方，此次大東溝之戰，奮勇效力，深堪嘉獎。加恩賞給二等第一寶星，以示鼓勵”。後又賞加雙眼花翎提督銜。
遣送回國
黃海海戰後，漢納根曾向清廷條陳節略，認為黃海海戰由於“中國海軍，近八年中未曾添一新船，所有近來外洋新式船炮，一概烏有，而倭之船炮，皆系簇新，是以未能制勝”。建議清政府向智利、德國、英國購買快船，聘請外國將弁水手同船來華，新舊合成一大軍，另派一洋員為全軍水師提督。同時建議加練陸軍10萬人以及向外國購買槍械等。清政府責成當時主持東征糧台的廣西按察使胡 與漢納根“悉心籌劃”，共同辦理。後因清政府款 及其他多種原因，漢納根的建議未能實現。遂離開北洋水師，仍任陸軍教習。清末轉而經營井陘煤礦（即今天河北省石家莊市井陘礦區） ，直到1917年中德斷交。1918年底被中國政府遣送回國。一戰結束後，1921年再度來華。因黎元洪的關係，開始二次經商。
1925年初，漢納根因患食道癌在中國天津去世。根據他的遺願，官方為他購買了一口水晶棺材，將他送回德國老家安葬，並送給他的遺孀10萬兩白銀。
