主要職能
實施水運管理體制改革的重要考慮，就是要實行水運建設與執法監管職能的分離，海事部門的主要工作職能集中到水上安全執法監督上來。
(一)宣傳、貫徹和執行國家有關法律、法規、規章和政策，組織擬訂和實施水路交通地方性法規、規章、規則及技術規範；依據法律法規和省交通廳委託，負責全省水路交通安全行政執法及監督檢查。
(二)擬定全省水路交通發展規劃和計畫,編報海事監督、船舶檢驗、航道管理、港航管理的新建改建（養護）工程項目年度計畫並組織實施；負責本行業統計信息工作。
(三)負責擬訂全省水路交通建設、養護管理辦法，經審批後組織實施；負責所轄水路交通建設和養護資金的籌措、撥付及使用監督。
(四)負責水上交通安全監督和防止船舶污染水域；對船舶所有人安全生產條件和水運企業安全管理體系實施監督管理；管理水上交通通航秩序和通航環境,劃定並管理航路、禁航區、交通管制區、港外錨地和安全作業區等；負責水上水下施工作業（含使用岸線）礙航性審核和監督檢查；組織和指導水上搜尋救助；管理沉船沉物打撈；管理和發布航行警（通）告；負責管理船員、引航員適任資格和其培訓機構的資質認可；負責本省船舶登記和簽證；調查、處理水上交通和船舶污染事故。
(五)負責船舶、水上設施檢驗和船舶適航管理；負責船舶及水上設施的法定檢驗；按規定許可權負責船用產品的認可和檢驗；按規定許可權審查船舶設計圖紙。
(六)參與組織、實施國家和省重點及大型水路交通基礎設施建設工程，歸口管理中、小型水路交通基礎設施建設工程。
(七)對全省水路運輸及運輸服務業市場、港口裝卸搬運市場、船舶修造市場實施行業管理；負責全省水路運輸行政管理、港口行政管理；組織和協調水路戰備軍事運輸。
(八)負責全省航道行政管理工作；負責航道通航技術標準審查；參與協調水資源綜合利用。
(九)受省交通廳委託實施水路交通規費的征稽管理；負責對本系統財務會計和內部審計工作的管理與指導。
(十)指導本行業科技工作，組織水路交通新技術、新工藝、新材料的推廣套用。
(十一)負責局機關和直屬單位的幹部人事、勞動工資、職工教育、機構編制、離退休人員管理工作；負責局機關及直屬單位黨群和紀檢監察工作；指導水路交通行業體制改革工作；指導本行業職工教育和精神文明建設。
(十二)承辦省政府、省交通廳交辦的其它事項。
組織機構
局領導
辦公室
政策法規處
計畫統計處
財務審計處
安全監督處
船舶船員處
船舶檢驗處
基本建設處
航道管理處
運輸綜合處
規費征稽處
科技教育處
人事處
機關黨委
工會
紀檢監察室
離退休人員辦
水上交通安全指揮監控中心
現任領導
黨委書記、局長：李建斌
黨委委員、副局長：孔華、劉仁煦、劉國平
黨委委員、紀委書記：毛建軍
黨委委員、總工程師：許足懷
管轄單位
局直單位
湖南省長沙航道管理局
湖南省益陽航道管理局
湖南省衡陽航道管理局
湖南省常德航道管理局
湖南省航務工程公司
湖南省航務勘察設計研究院
湖南省湘航聯運總公司
湖南省航務管理局海員俱樂部
湖南省航務管理局印刷廠
湖南明珠實業發展有限公司
海事機構
湖南省長沙市地方海事局
湖南省岳陽市地方海事局
湖南省株洲市地方海事局
湖南省婁底市地方海事局
湖南省邵陽市地方海事局
湖南省永州市地方海事局
湖南省郴州市地方海事局
湖南省張家界市地方海事局
湖南省湘西土家族苗族自治州地方海事局
湖南省衡陽市地方海事局
湖南省湘潭市地方海事局
湖南省益陽市地方海事局
湖南省懷化市地方海事局
湖南省常德市地方海事局
港航管理機構
衡陽市交通運輸管理處
益陽市港航管理處
常德市港航管理處
懷化市交通運輸管理處
湘潭市港航管理處
航道管理機構
常德市航道管理處
懷化市航務管理處
益陽市地方航道局
