歷史沿革
2000年4月，珠府辦函（2000）55號文，珠海市人民政府批准成立“淇澳紅樹林保護區”，由淇澳管理區管理。
2002年2月，市林業局正式接管淇澳紅樹林保護區。
2004年11月，粵辦函（200）383號文，廣東省人民政府批准同意將淇澳島自然保護區和擔桿島省級自然保護區合併，建立“珠海淇澳—擔桿島省級自然保護區”，市野生動植物保護管理所所長盧海洋兼管保護區全面工作。
2005年5月，為健全淇澳—擔桿島省級自然保護區管理機構，市農業局副局長楊堯同志任第一屆管理處主任，具體業務委託市野生動植物保護管理所負責。
2006年1月，珠海淇澳—擔桿島省級自然保護區管理處籌建正式完成，並獨立辦公。
2006年7月，市委組織部正式任命楊雄邦同志為珠海淇澳—擔桿島省級保護區管理處第二屆主任，負責保護區全面工作。
植物資源
淇澳紅樹林保護區內擁有維管植物165科470屬695種（野生植物140科398屬556種，栽培植物65科106屬139種）。在野生維管植物中，其中蕨類植物19科28屬39種；裸子植物3科3屬4種，被子植物118科367屬513種。其中紅樹植物達10科13屬15種，分別占中國現有紅樹科、屬、種的83.3%、86.7%和55.6%；半紅樹植物達7科9屬9種，分別占中國現有半紅樹科、屬、種的77.8%、90%和90%；紅樹林伴生植物為11科15屬15種，分別占中國紅樹林伴生植物科、屬、種的73.3%、71.4%和68.2%。
淇澳島真紅樹與半紅樹種類
科名 中文種名 學名 類型
紅樹科Rhizophoraceae 秋 茄 Kandelia candel(L.)Druce． 真紅樹
木 欖* Bruguiera gymnorrhiza(L.)Lam. 真紅樹
紅海欖* Rhizophora stylosa Griff. 真紅樹
鹵蕨科Acrostichaceae 鹵 蕨 Acrostichum aureum Linn． 真紅樹
紫金牛科Myrsinaceae 桐花樹 Aegiceras corniculatum(L.)Blanco． 真紅樹
海桑科Sonneratiaceae 海 桑 Sonneratia caseolaris(L.)Engler． 真紅樹
無瓣海桑* Sonneratia apetala Buch-Ham． 真紅樹
大戟科Euphorbiaceae 海 漆 Excoecaria agallocha L. 真紅樹
爵床科Acanthaceae 老鼠簕 Acanthus ilicifolius Linn． 真紅樹
馬鞭草科Verbenaceae 許 樹 Clerodendrum inerme(Linn)Gaertn． 半紅樹
梧桐科Sterculiaceae 銀葉樹 Heritiera littoralis(Dryand.)Ait． 半紅樹
使君子科Combretaceae 拉關木* Laguncularia racemosa Gaertn. f. 真紅樹
菊科Compositae 闊苞菊 Plucheaindica Less． 半紅樹
夾竹桃科Apocynaceae 海芒果 Cerbera manghas L． 半紅樹
錦葵科Malvaceae 楊葉肖槿 Thespesia populnea(L.)Soland． 半紅樹
黃 槿 Hibiscus tiliaceus L. 半紅樹
豆科Leguminosae 水黃皮 Pongamia pinnata(L.)Merr． 半紅樹
動物資源
淇澳島紅樹林濕地保護區內共擁有底棲動物5綱14目48科103種；魚類1綱10目41科90種；有陸生脊椎野生動物4綱25目，58科1 56種（含兩棲動物15種、爬行動物27種、鳥類99種、哺乳動物15種）。同時，保護區境內有屬國家重點保護動物，也是珍稀瀕危動物總計15種，占廣東省珍稀瀕危動物總數（117種）的12.8%，其中國家Ⅰ級重點保護動物有1種（中華白海豚），
Ⅱ級重點保護動物14種（如虎紋蛙、鳶、風頭鷹、赤腹鷹、松雀鷹、水獺等），
淇澳島保護區是中國三大候鳥遷徙路徑之一，秋冬季棲息著許多跨境的越冬候鳥和在此停留的候鳥，這些種類許多都是國際協定中的保護鳥類，如中日候鳥保護協定中的34種鳥類，占候鳥保護協定總數（227種）的15%；中澳候鳥保護協定中的16種鳥類，占中澳候鳥協定總數（81種）的19.8%，此外，區內還具有瀕危野生動植物種國際公約確定的物種20種。另外，還有廣東省省級重點保護動物的17種，
國家“三有”保護動物113種。
從1999年起，珠海市政府每年撥專款120萬元，實施淇澳島紅樹林紅樹植物群落的引種擴種工程，陸續從海南島引進海桑、木欖、紅海欖等，極大地豐富了淇澳島的物種多樣性。淇澳島的紅樹林經過珠海市政府連續5年的投資建設，從開始只有32公頃發展到目前的533公頃，已成為珠江三角洲地區紅樹林擴種面積最大的區域，也成為目前國內人工種植連片面積最大的紅樹林。
