海藻糖的兩個葡萄糖分子構型為六元環的吡喃葡萄糖構型,通過α-1,1糖苷鍵連線。
由於兩個葡萄糖分子可以形成α-吡喃葡萄糖和β-吡喃葡萄糖,通過α-1,1糖苷鍵連線可以得到三種異構體:海藻糖(α,α)、異海藻糖(β,β)和新海藻糖(α,β)。
基本信息欄中的信息均為海藻糖(α,α)的相關數據。
命名
把葡萄糖結構視作取代基命名,α-D-吡喃葡糖基-α-D-吡喃葡糖苷
按照IUPAC命名法,海藻糖英文命名為:
(2 R,3 S,4 S,5 R,6 R)-2-(Hydroxymethyl)-6-[(2 R,3 R,4 S,5 S,6 R)-3,4, 5-trihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxyoxane-3,4,5-triol
二水合物
海藻糖常以二水合物形式存在。
二水合物的分子式為CHO,CAS登錄號為6138-23-4。