建院以來,在常見病、多發病的中醫藥防治,中藥新藥開發,中醫文獻研究發掘以及蠶業資源、海洋生物資源等藥用資源研究方面取得了顯著的成績。歷年來研究院科技人員共研製胃復春、養胃沖劑、黃芪生脈飲等新藥30餘只,獲得各級科技成果獎勵100餘項次,其中獲國家及省部級科技成果獎勵60餘項次。如“中藥光敏劑診治惡性腫瘤的研究”獲國家中醫藥管理局科技進步一等獎,《醫方類聚》獲衛生部科技進步二等獎獲得專利4項,撰寫發表學術論文600餘篇,出版學術專著近100部(種)。尤其在“十五”期間,研究院更有長足的發展,確立了以臨床醫學研究、中藥新藥開發、中醫文獻信息研究、中西醫結合精神衛生等為研究院今後重點研究領域,擁有6個省衛生廳重點學科、兩個國家中醫藥二級實驗室、四個省中醫藥重點實驗室。承擔各級課題169項,其中國家級2項,省部級46項。先後有29項科研成果通過鑑定、驗收,申報國家專利9項,獲國家發明專利2項,開展橫向課題、技術服務項目100餘項,轉讓新藥7項。獲得各級獎項30項,其中“蠶砂提取物研製中藥二類新藥生血寧片”獲國家科技進步二等獎,該藥2004年銷售額達1.5億元;“藥用新輔料殼聚糖及其製劑冰硼膜”獲浙江省中醫藥科技創新一等獎,殼聚糖2005年年銷售額達1.5億元。
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