截止2018年2月統計，該所有在職幹部職工61人，退休人員63人，其中科研人員44人，包括正高級7人、副高級10人，博士3人、碩士17人；享有國務院政府特殊津貼專家1人、省政府特殊津貼專家1人，省勞動模範1人，省百千萬人才1人，西部之光訪問學者1人，省百人遠航人才1人。
研究所內設辦公室（黨委辦公室）、科研服務科、紀檢監察室、水產養殖與遺傳育種研究室、水產動物營養與病害防治研究室、漁業資源與環境保護研究室、漁業工程與水產品加工研究室、漁業經濟信息研究室8個部門。主要承擔我省水產科學技術的研究開發、成果轉化，漁業資源、漁業生態環境的調查、監測等工作。
目前，研究所擁有農業部湖泊漁業資源環境科學觀測實驗站、農業部江西江豚救護中心、全國漁業生態環境監測網路成員單位、省贛江生態漁業科技園、省名特優水產苗種繁育基地、省觀賞魚良種繁殖場、省級四大家魚良種場等科研試驗平台；建有專業實驗室面積2000餘平方米，現有實驗室儀器設備460餘台（套）。建所以來，承擔國家和省部級以上科研項目150餘項，獲省部級科技獎項30餘項，發表學術論文（論著）500餘篇（部），授權發明專利8項，實用新型專利40餘項，為江西現代漁業發展發揮了重要的科技支撐作用。
