２００４年２月，在江蘇省民政廳、揚州市衛生局的關心支持下，醫院正式託管揚州市第二人民醫院的精神衛生部分（含市心理衛生中心、精神科、心身病房及自願戒毒所等），此舉結束了揚州市區精神科專科醫院“一市兩院”資源配置不合理的局面，實現了揚州市精神衛生醫療市場資源的最佳化組合，為我院進一步做精做強精神科、心理科等相關學科奠定了堅實基礎。
醫院現有職工４１８人，開放床位７３０張，設有臨床精神科、神經內科、臨床心理科、心理衛生中心、老年康復科、司法鑑定所、自願戒毒所等臨床科室，開設了癲癇專病、失眠專病、頭痛專病、兒童多動與學習困難專病、老年記憶障礙專病、心理危機干預等特色服務項目。
醫院擁有螺鏇CT、腦電HOLTER（２４小時動態腦電圖）、眼動檢查儀、多功能生物反饋儀、MECT（無抽搐電休克治療儀）、肌電圖及全套心理測試計算機分析系統等先進的診療設備。
醫院堅持“科教興院”的發展戰略，在努力做好臨床醫療服務的同時，十分重視教學和科研工作。近幾年來，先後獲得省、市科技進步獎１０多項，醫院已成為揚州大學醫學院附屬醫院、徐州醫學院教學醫院、皖南醫學院教學醫院、揚州大學教育科學與技術學院心理科學研究實驗基地、法務部心理諮詢和犯罪心理矯治培訓基地、揚州市心理援助中心、揚州市心理諮詢師培訓基地、揚州市心理衛生協會培訓中心及揚州市青少年心理諮詢中心。
