上海市1953年以黃浦江、蘇州河及其68條支流水域設定。因居民都是散居水上的船民，故名。1956年年底因散居水上船民大部分都已在陸上定居而撤銷。
微山湖抗日根據地水上區1938年3月16日，日本侵略軍占領了夏鎮。夏鎮是微山湖東岸的重鎮，是水產和農副產品的集散地，是微山、昭陽西湖的煙喉。占據了夏鎮，日軍扼水陸交通，在沿湖一帶修建兵營，構築工事，搶掠財物，焚燒民房，好淫婦女，槍殺民眾。還編造戶口，頒發“良民證”，推行法西斯統治。
為開闢微山湖抗日根據地，1938年12月，湖西區黨委決定成立了中共沛滕邊區縣委，翌年又建立了統戰性質的政權機構——沛滕邊區聯合辦事處。下轄夏鎮特區、沛七區、滕八區三個區。1939年8月，為組織發動漁徹民進行抗日救亡運動，便在微山湖同昭陽湖交界處的大捐為中心建立了水上區。
水上區一經建立，就形成了一個堅強有力的戰鬥集體，很快打開了抗日鬥爭的新局面。水上區中有年青能幹、辦事果斷的區委書記張延凱，有機敏風趣、駛船好把式的區長黃克儉，有膽大善戰的副區長殷正平，有人稱“老大姐”的婦女委員傳玉梅，有說話慢聲細語的“老實人大哥”、組織委員常德芳，有漁民中的小秀才、民運委員劉翰華。由於水上區一班人大刀闊斧地開展工作，全區十幾個船幫（村）很快就建立了青、漁、婦、妹妹、兒童組織。區委還不斷地在積極分子中發展黨員，建立黨的組織，到1940年10月，水上區共有黨員20多人，成立了槍（箔）幫、清帝、載船幫支部和貨船幫支部。槍、胃、載三帝支部書記劉流華，貨船幫支部書記姜興茂。
1940年7月，潘復生率領一批幹部，由山東分局到達滕股邊區，準備過湖建立湖西區黨委。因湖西形勢緊張，日、偽、頑聯合向革命根據地進攻，湖西地區已縮小成“一槍能打透的根據地”。潘復生等同志暫留沛滕邊區，成立了湖西五縣工委，潘復生任書記。五縣工委在湖上召開了幾次會議，沛滕邊區縣水上區每次都列席會議，並且負責會議的後勤工作。
1940年的9月初，根據縣委的指示水上區委決定，留下一半力量，堅持湖上工作，一半由劉流華帶隊開闢新區。水上區委兵分兩路，在百里蘆盪，廣泛發動民眾，組織抗日救國團體，督促鄉、保兩面政權，籌集糧草和船隻，供應五縣游擊大隊進、出湖和駐紮休整的需要。一段時間，形勢比較好，鄉保籌備糧草和船隻還算認真，後來形勢惡化了，鄉保就採取應付的態度，儘量拖長時間，催得緊了，只給少量粗糧、紅芋和碎濕柴草。到了11月份，形勢更加惡化，日、偽、頑準備勾結起來，聯合向我進攻。頑軍最猖狂，湖東的周們，湖西的馮子固遙相呼應，便衣偵探往來頻繁、窺視偵察、作試探性進犯。水上區委從微山島和湖裡撤回來，安在南莊，聽候縣委指示。11月24日下午，區委在三孔橋召開會議，張延凱傳達了縣委意見，敵人即將向我進攻，我們要向湖西撤退。並決定部分同志留下。配合縣委留下的同志，進行秘密活動。與此同時，水上區委為西撒的一千多黨政軍民操辦了幾十隻船，籌備了糧草，為勝利西撒做出了突出貢獻。
1941年3月，沛滕邊縣委從湖西遷回來，由於種種原因，水上區沒有恢復，但卻保留了水上區公所，負責管理漁民的生活、生產以及交通船隻、水產稅收等，區長仍為黃克儉。區公所有一個班的武裝作保衛工作。湖上的黨、團和民眾工作由縣委直接領導，並派工作組長李玉章等，在湖裡領導工作。
1941年 8月，縣委委派劉流華擔任水上自衛團長。水上自衛團受水土區公所領導，主要任務是供應船隻，運送部隊和工作人員過湖或下湖休整，籌備食宿，蒐集情報，瓦解日、偽、頑軍等。這一段時間，水上區配合活躍在微山湖上的抗日地方武裝鐵道游擊隊、做湖大隊、運河支隊做了許多帶有傳奇色彩的工作。如“火燒汽艇”，在截獲日軍布料時的運輸工作，護送幹部過湖等。
抗戰8年，水上區共發展黨團員偽餘人，動員了近百名青年參軍參戰。許多入伍的漁湖民轉戰南北，成了我黨我軍中級領導幹部。
1944年7月，臨城縣成立，水上區隨著沛滕邊區縣一齊撤銷，完成了它的歷史使命。
