研究領域
桂起權主要在兩個領域從事研究。
（1）在科學哲學界，他屬於“本義的科學哲學派”，大力提倡“分科的科學哲學”研究綱領，主張科學哲學與科學思想史研究密切相結合。他在博士生的培養上和本身最有影響力的工作，主要在於物理學哲學（尤其是量子力學哲學，在武漢他發起了一個“物理學哲學的科學共同體” ），生物學哲學（特點在於在生物學中將“複雜性系統科學”解釋模式一貫到底，並且將科學哲學普遍原理與生物學特異性結合起來），經濟學方法論等等研究；並且積極推動計算機科學哲學與化學哲學的研究。
（2）在邏輯界，他屬於非正統、非經典邏輯派那一方。在國內是次協調邏輯的首先引介者之一，並被認為是國內辯證邏輯形式化弱綱領的主要代表之一。
個人作品
書籍
《科學思想的源流》（1994）
《當代數學哲學與邏輯學入門》（1991）
《哲人科學家：玻恩》（兩人合著，1996）
《海森伯傳》（兩人合著，1999）
《觀察與實驗》（兩人合著）
《機遇與冒險的邏輯——歸納邏輯與科學決策》（三人合著1996）
《次協調邏輯與人工智慧》（三人合著，2002）
《生物科學的哲學》（三人合著，2002）
《規範場論的哲學探究》（第一作者，2008）
《物理學哲學研究》（兩人合著，2012.）
譯著
《科學哲學》[日]（兩人合譯，1994）
《機器人與人類心智》[美]（三人合譯，1993）。
若計及多人合著的著作，總數超過46本。
論文
《邏輯圓論——一種由歐拉圖導出的三段論系統》（1981）
《對應原理——多種非經典邏輯的通用原理》（兩人合著，1992）
《辯證邏輯形式化研究綱領》（兩人合著，1992）
《析量子力學的辯證法——玻爾的互補性構架》（1994）
《對應原理——多種非經典邏輯的通用原理》（兩人合著，1992）、
《析量子力學的辯證法——玻爾的互補性構架》（1994）、
《目的論自然哲學之復活》（1995）、
《目的論自然哲學之復活》（1995） 《綱領方法論的經濟學套用》（2001）
《科學研究綱領方法論的經濟學套用》（2001）、
《系統科學：生物學理論背後的元理論》（2003）、
《生物學哲學中的綱領方法論》（2004）；
《對計算機模擬中的邏輯、方法論的幾點認識》（2005）
《夢：形象思維的畢卡索藝術——相似聯想、形象模擬及隱喻》（2005）
《馬克思<資本論>的辯證邏輯與鄧小平的“兩重性邏輯” 》（2006）
《經濟學的科學邏輯研究綱領》（2007）
《對稱性破缺與宇宙設計》（2007）
《充實的真空：量子場的實在論與生成辯證法》（2007）
《規範場論的研究綱領述評》（2008）
《我們的物理學哲學研究的核心理念》（2010）、
《EPR佯謬、量子實在的弱個體性與遠程關聯》（兩人合著，2010）；
總計約190餘篇。
成就及榮譽
桂起權主持並完成多項國家級課題。其中，教育部博士點基金項目有：（1）哥本哈根派科學哲學研究；（2）次協調邏輯研究；（3）生物學哲學研究研究。國家社會科學基金項目有：（1）系統科學與辯證法研究；（2）物理學哲學研究。2004年通過國家鑑定，評為優秀。教育部人文社會科學重大項目有：物理學前沿的哲學問題——規範場論的哲學意義研究（02ZAZJD720012）。
演講視頻
2011-12-16：從邏輯哲學看量子邏輯
社會評價
“桂起權老師主要從事分科的科學哲學研究，曾在2006年出版《生物科學的哲學》一書，多年來發表過數篇生命科學哲學的論文。雖然今年已有70歲高齡，但桂老師依然精神灼爍，口若懸河，圍繞他所熱愛的生命科學哲學，滔滔不絕地講演了3個小時，為滿座的聽眾帶來一場智慧上的饕餮盛宴。”
