![李曉琴[北京工業大學生命科學與工程學院教授]](/img/6/5e2/nBnauM3XyETN4AjMxgjM1kTO0UTMyITNykTO0EDMwAjMwUzL4IzLxgzLt92YucmbvRWdo5Cd0FmLwE2LvoDc0RHa.jpg "李曉琴[北京工業大學生命科學與工程學院教授]")
研究方向
1. 生物信息學：開展蛋白質摺疊模式識別、蛋白質結構與功能關係、蛋白質結構進化、基因組序列分析等方面的研究工作。
2. 生物醫學信息學：開展與人類健康密切相關的重大疾病的信息學研究。
研究項目
1. 核酸非編碼序列信息內容分析 國家自然科學基金(1997.1-1999.12) 骨幹。
2. 蛋白質拓撲結構的識別、構建和預測 國家自然科學基金(2000.1--2002.12) 骨幹。
3. 胺基酸分類與蛋白質拓撲結構關係的研究 內蒙古大學青年基金(1998.7-2000.12) 主持。
4. mRNA序列與蛋白質結構調控關係研究 內蒙古自然科學基金(2001.1--2002.12) 主持。
5. 藥物分子與靶蛋白結合動力學分析軟體的設計開發 內蒙古自然科學基金(1998.9--2000.12) 主持。
6. 從mRNA序列經肽鏈的α和β摺疊到蛋白質框架結構的經驗規律探索 國家自然科學基金重大項目(2002.1--2004.12) 子課題主持
7. mRNA轉譯、新生肽鏈摺疊和蛋白質二級結構編碼研究 北京工業大學博士科研啟動基金 (2003.10--2005.10) 主持。
8．蛋白質摺疊信息資料庫及摺疊經驗規律探索 國家自然科學基金資助項目（2006.1--2008.12）（項目編號：30570427） 主持
9．蛋白質摺疊信息資料庫及摺疊經驗規律探索 北京市自然科學基金資助項目（2006.1--2007.6）（項目編號：4063035） 主持
10．北京市中青年骨幹教師項目 主持
科研成果
1.Q Wang,JL Yan,XQ Li.The Recognition of 124-Class Protein Folds: Approached by Functional Domain Composition. Computational Biology and Chemistry. 2014,48(2):71-76
2.HS Xu ,XQ Li.Identifying Coevolution Between Amino Acid Residues in Protein Families: Advances in the Improvement and Evaluation of Correlated Mutation Algorithms.Current Bioinformatics. 2013,8(2):148-160.
3.JL Yan,ZW Chen, HS Xu ,XQ Li. Protein Fold Recognition by Functional Domain Composition. Prog. Biochem. Biophys. 2011,38(2):166-172
4.Hai Song Xu, Wen Ke Ren, Xiao Hui Liu and Xiao Qin Li .Aligning protein sequence and analyzing substitution pattern using class-specific matrix.Journal of Biosciences. 2010,35(2):295-314
5.Qiao Hui , Li Xiao-Qin,Xu Hai-Song,Kong Ling-Qiang,Peng Yu. Specificity of Cation-π Interactions in Typical Protein Folds. Acta Physico-Chimica Sinica.2010, 26 (10): 2828-2832
6.Liu Yue,Li Xiao-Qin,Xu Hai-Song,Qiao Hui. Classification Modeling and Recognition of Protein Fold Type.Acta Physico-Chimica Sinica.2009, 25 (12): 2558-2564
7.李曉琴,劉岳. 基於LIFCA分類系統的蛋白質摺疊識別軟體V1.0.登記號:2009RBJ4059
8.Wen-Ke Ren, Hai-Song Xu, Xiao-Qin Li.Identification of Globin-like fold proteins with Structural-based profile Hidden Markov Model. Prog Biochem Biophys.2008,35(5):548:554
9.Wei Zhang, Xiao-Qin Li, Hai-Song Xu, Wen-Ke Ren. Study on protein fold type recognition.Acta Biophysica Sinica.2008,241):65-71
10.劉曉輝,李曉琴,徐海松,任文科.構建基於摺疊核心的全α類蛋白取代矩陣.中國生物化學與分子生物學報.2008,24(8):761-766
11.李曉琴,張瑋. 蛋白質結構類及摺疊類型識別軟體V1.0 計算機軟體著作權登記號：2007SRBJ0486
12.LF Luo, MW Jia, XQ Li.Protein-Structure-PreferencetRNA Copy Number and mRNA Stem/Loop Content. Biopolymers.2004(74):432-447
13.Li XQ,Luo LF. The relation between translation speed and protein secondary structure. ACTA Biochimica Biophysica Sinica.2003(35)2:193-196
14.XQ Li, LF Luo. The recognition of protein structural class. ProgBiochem Biophys. 2002,29:938-941
15.LF Luo, XQ Li.construction of genetic code from evolutionary stability.BioSystems. 2002(65):83-97
16.LF Luo, XQ Li.Coding rules for amino acid in the genetic code: the genetic code is aminimal code of mutational deterioration.Origins of life and Evolution of the Biosphere.2002(32):23-33
17.XQ Li, LF Luo. The definition and recognition of protein structural class.Prog Biochem Biophys.2002(29)1:124-127
18.XQ Li, LF Luo. Recognition and Architecture of the Framework Structure of Protein. Proteins: Structure, Function and Genetics.2000(39):9-25
