一、人物簡介
李友元,1977年2月生,安徽樅陽人,博士。1999年獲得北京工商大學(原北京輕工業學院)生物化工學士學位,2002年獲得華東理工大學發酵工程碩士學位,工作於華東理工大學生物反應器工程國家重實驗室(生物工程系), 從事發酵過程最佳化與微生物代謝調控研究,蛋白質組學研究,並擔任一定的教學工作。2012年獲得華東理工大學生物化工博士學位。
研究領域為工業生物過程最佳化與調控,在生物化工、生物信息學、蛋白質組學及基因工程等研究方向發表研究論文19篇,其中第一作者論文8篇(包含期刊Molecular&Celluar Proteomics,2011 IF7.398;Metabolic Engineering, 2015 IF8.201),通訊作者3篇,其它作者8篇(包含期刊Journal of Proteomics,2012IF:4.088)。h指數為7,i10指數為4,單篇最
高引用50次;授權專利1項,公開1項;獲計算機軟體著作權1項。
二、教育背景
2.1 教育背景
1995.9-1999.7 北京工商大學(原北京輕工業學院)獲工學學士學位
1999.9-2002.3 華東理工大學 生物工程學院 獲發酵工程碩士學位
2002.4至今 華東理工大學 生物工程系 工作
2004.9至今 華東理工大學 生物工程系 在讀博士學位
2009.6-2009.9 澳大利亞 拉籌伯大學 訪問學者
2014.1-2015.7 美國 麻省理工學院 博士後
2.2 其它特長
大 學期間輔修計算機技術與套用專業,系統學習了計算機的專業知識,並獲得國家二級C語言、FORTRAN語言優秀證書。碩士期間,又自學了VB、網路編程、 資料庫編程等技術,在業餘時間內先後完成“生物工程學院教務管理系統”、“生物工程系綜合實驗遠程選課系統”、“華東理工大學會議室線上預定系統”、“生 物工程系實驗室管理系統”和“生物工程實驗教學中心網站”,在實際套用中起到了良好的效果。
同時,進一步將計算機技術和科研結合起來,編程進行質譜數據分析工作,編製程序機器人(Oligo-Masker)控制生物信息學軟體進行大批量計算,並自動提取、匯總目的數據,極大的提高了科研效率。
三、科研項目
目前研究方向:生物過程控制與最佳化、蛋白質組學、生物信息學,生物過程工程大數據
2012-1016 參與 “高通量優選儀器開發及套用”子課題“非接觸式光電化學檢測技術及部件2012YQ15008706”,國家重大科學儀器設備開發專項, 562.67萬/6096萬
2012-2014 “基於多位點酶切肽段的混合蛋白質直接鑑定研究”, 2012年中央高校基本科研業務費專項資金資助,15萬元
2012-2014 “高蛋白酶活性的工業生物過程蛋白質組學關鍵問題研究”, 2012年生物反應器工程國家重點實驗室開放課題支持,7萬元
2008-2010 “一維預分離結合生物質譜直接鑑定混合蛋白質”, 2008年生物反應器工程國家重點實驗室開放課題支持,3萬元
2007/11-2009/11 “上海生物過程工程專業技術服務平台(07DZ22914)”,第三負責人,負責平台整體建設和運行,300萬元
2004-2006 “丙酮酸生物合成代謝調控”,運用代謝工程理論研究丙酮酸生物合成,通過相關酶及代謝途徑的調控,提高丙酮酸產量、產率和生產強度。
2003-2004 “紅黴素發酵雜質分析與最佳化”,主要承擔紅黴素發酵雜質線上分離及定性分析工作,並指導工藝最佳化,對紅黴素產品質量控制起到了非常重要的作用。
1999-2002 “螺旋黴素代謝研究及工藝最佳化”,主要承擔基礎理論研究及發酵小試工作。該項目使企業年增利稅1300萬以上,取得明顯經濟效益,受到企業嘉獎。該成果獲得2003年上海市科學技術進步三等獎。
四、教學教育
4.1 教學任務
1)《發酵工程基礎實驗》、30學時
2)《發酵工程綜合實驗》、60學時
3) 雙語課程《BioInformatics》、16學時
4.2 教育任務
1)協助指導研究生
2) 指導本科生畢業論文、USRP項目
3) 帶隊下廠實習
4)擔任生工02級班導師、理工優秀生部062班導師
五、主要成果
5.1 學術論文
第一作者:
1. Jens Plassmeier, Youyuan Li (Co-First Author), Christian Rückert and Anthony J. Sinskey, Metabolic Engineering Corynebacterium glutamicum to Produce Triacylglycerols, Metabolic Engineering, (2015IF:8.201)
2. Youyuan Li、Pei Hao、Siliang Zhang*、Yixue Li:Feature-matching Pattern-based Support Vector Machines for Robust Peptide Mass Fingerprinting,《Molecular & Cellular Proteomics》,10: 10.1074/mcp.M110.005785, 1–17, 2011(2011IF 7.398)
3. 李友元、莊英萍、張嗣良:生物信息軟體的自動化策略與實現,《計算機工程》,37(4):81-83,86,2011
4. 李友元、陳長華、顧熠峰等:基於液質聯用技術解析和最佳化螺旋黴素發酵雜質,《生物工程學報》,21(2):275-278,2005
5. 李友元、陳長華、陶萍:螺旋黴素生物合成中間代謝物的LC—ESI—MS定性分析,《分析測試學報》,21(3):40-43,2002
6. 李友元、陳長華:螺旋黴素生物合成代謝流量分析,《中國抗生素雜誌》, 27(2):101-103,2002
7. 李友元、陳長華、陶萍:高效液相色譜法測定螺旋黴素發酵液中的有機酸,《色譜》, 20(1):46-48,2002
8. 李友元、陳長華、李永東、李東紅:醯基激酶和醯基CoA合成酶對螺旋黴素合成的影響,《華東理工大學學報》,27(3):251-254,2001
通訊作者:
9. 李雅萍、 李友元*、周新文、陳長華、張嗣良、楊芃原:超音波輔助Urea-Free試劑結合熱變性快速酶解蛋白質,《分析化學》,38(5):663-667,2010
10. 王翠華、 李友元*、陳長華、李嘯:溫度對丙酮酸生物合成動力學、能荷和氧化-還原度的影響。《生物工程學報》22(2):316-321,2006
11. 王翠華、 李友元*、陳長華、李嘯:Torulopsis glabrata在丙酮酸生產過程中的能荷變化和氧化還原度趨勢。《華東理工大學學報》32(5):552-555,582,2006
其他作者:
12. Yin Peng, Li You-Yuan, Zhou Jin, Wang Yong-Hong, Zhang Si-Liang, Ye Bang-Ce, Ge Wei-Feng, Xia Yue-Lan, Direct proteomic mapping of Streptomyces avermitilis wild and industrial strain and insights into Avermectin production,Journal of Proteomics,79:1-12,2012 (doi: 10.1016/j.jprot.2012.11.012,2011 IF 4.878)
13. 李為全、陳海軍、陳長華、 李友元:糖代謝關鍵酶活性對林可黴素生物合成影響的研究。《藥物生物技術》, 14(6):424-428,2007
14. 李嘯、陳長華、 李友元:紅黴素A發酵條件的最佳化。《中國醫藥工業雜誌》,37(6):381-383,2006
15. 李嘯、陳長華、 李友元:金屬離子對紅黴素生物合成的影響。 《中國抗生素雜誌》,31(6):366- 371,2006
16. 李嘯、陳長華、 李友元、塗志英:鉬對紅黴素生物合成的影響。《三峽大學學報》,28(4):355-359, 2006
17. 李嘯、陳長華、 李友元:紅黴素發酵生產後期的調控研究。《三峽大學學報》,27(6):555-558,2005
18. 李嘯、陳長華、朱鳳、 李友元:“紅黴素生產及其有效組分轉化的最佳化”,《中國抗生素雜誌》,30(2):65-69,2005
19. 王恆偉、陳長華、付水林、 李友元:“腺苷發酵液中有機酸的代謝規律”,《華東理工大學學報》,30(2): 223- 226, 2004
5.2 學術成果及獎勵
2012.10 專利《一種紅曲色素高產菌株的高通量篩選方法》,儲炬,譚俊,王永紅, 李友元,莊英萍,張嗣良,郭元昕 公開號:CN 103725669A
2011.11 專利《一種快速酶解混合蛋白質的方法》, 李友元,李雅萍,王永紅,陳長華,儲炬,莊英萍,張嗣良,授權號:CN 101457247B
2007.06 專利《生物合成丙酮酸的方法》,陳長華、 李友元、范棟,公開號:CN 101096691
2005.07 河南省駐馬店市科技進步一等獎,《金屬離子促進螺旋黴素的生物合成》,毛全貴、趙勝利、王振坤、朱義彬、劉守強、 李友元、韓德全、張永紅、漢國旗、馬德遂、陳長華、陳國豪
2004.11 獲上海市優秀碩士論文獎
2003.01 上海市科學技術進步獎三等獎,《套用醯基激酶和醯基CoA合成酶激活劑提高螺旋黴素產量》,陳長華、陳國豪、 李友元、毛全貴、楊明、王振坤、蔡寶菊
2002.04 通過上海市科學技術成果鑑定,《套用醯基激酶和醯基CoA合成酶激活劑提高螺旋黴素產量》,陳長華、陳國豪、 李友元、毛全貴、楊明、王振坤、蔡寶菊
2002.04 獲華東理工大學“二○○二屆研究生優秀畢業生”稱號
2001.08 獲上海化學化工青年科技論壇論文三等獎
2001.06 獲“江蘇華昌”獎學金
2000.09 獲中國藥學會學術年會優秀論文二等獎
5.3 教育成果及獎勵
李友元,陳長華,宮衡,張嗣良,付水林,楊雅琴.發酵工程實驗教學改革探索與實踐. 化工高等教育,2013, 30(6):27-30
2012.10 2012年度華東理工大學教育教學成果三等獎,《深化實驗教學方法改革,踐行發酵工程實驗多層面互動教學》, 李友元、宮衡、張嗣良、付水林、楊雅琴
2012.10 2012年度華東理工大學教育教學成果一等獎,《深化<生物分離工程>國家精品課程建設內涵,培養卓越生物工程創新人才》,曹學君,萬俊芬,趙延斌,龔小雁, 李友元,劉坐鎮,許環昕,張秀萍
2010 《生物分離工程》獲國家級精品課程稱號,生物分離工程精品課程團隊成員
2009.07 參編普通高等教育“十一五”國家級規劃教材,《發酵工程實驗》,陳長華著,ISBN 9787040267181,高等教育出版社,2009
2008.09 2008年度華東理工大學教學成果一等獎,《發酵工程精品課程建設》獲(張嗣良、宮衡、陳長華、李友元、高淑紅)
2006 《發酵工程》獲國家級精品課程稱號,發酵工程精品課程團隊成員
曹學君、趙延斌、童望宇、劉葉青 、 李友元、張秀萍、許環昕.生物分離工程精品課程建設推動教學質量躍上新台階.《化工高等教育》,88(2):32-34,2006