機構設定
（一）辦公室
曲靖市衛生和計畫生育委員會負責文電、會務、機要、檔案、行政事務、信息、督查、政務公開、來信來訪、新聞發布、安全保密、對外交流、綜合協調和後勤保障等工作；辦理人大代表建議和政協委員提案；負責衛生計生信息化建設，組織衛生計生年鑑的撰寫等工作。
（二）規劃財務科
擬訂全市衛生計生事業發展規劃、區域規劃、資源配置標準、裝備標準、服務標準和衛生計生財務管理規章制度，負責財務、資產管理、內部審計和統計工作；負責管理和指導衛生計生相關基本建設項目和資金使用，負責衛生計生專項經費的監督使用。
（三）政策法規科
承擔有關規範性檔案的審核、行政複議和行政應訴工作；指導監督衛生計生系統法制宣傳教育和有關行政執法工作；承擔本部門行政審批制度改革及職能轉變相關工作；參與貫徹落實深化醫藥衛生和計畫生育體制改革重大方針、政策工作；開展食品安全監測、風險評估和預警工作；承擔行政處罰的審查和監督，督辦重大醫療衛生計生違法案件；負責衛生計生監督執法人員資格培訓發證工作等。
（四）衛生應急辦公室（突發事件應急指揮中心）
擬訂衛生應急和緊急醫療救援預案和措施，指導突發公共衛生事件的預防準備、監測預警、處置救援、分析評估等工作；組織實施重大災害和重大突發事件的應急處置和緊急醫療救援；負責衛生應急隊伍建設，發布突發公共衛生事件應急處置信息。
（五）疾病預防控制科
擬訂全市疾病防治規劃和兒童免疫規劃並組織實施，完善疾病預防控體系，防止和控制疾病發生和疫情蔓延；負責重大傳染病、地方病、慢性病、精神病、職業病的綜合防治、監測和疫情報告。
（六）醫政醫管科
擬訂醫療機構、醫療技術套用、醫療質量、醫療服務、醫療安全、采供血機構管理等有關地方規範和標準並指導實施；承擔建立醫療機構醫療服務、醫療質量評價和監督體系的有關工作；擬訂醫務人員執業標準和服務規範；指導醫療機構藥事、醫療機構感染控制、醫療急救體系建設、臨床實驗室管理等有關工作；擬訂公立醫院運行監管制度。
（七）基層衛生科
擬訂全市農村衛生工作規劃並指導實施。指導基層衛生綜合改革，負責社區衛生服務、農村基本衛生服務工作綜合管理與評估；組織實施國家基本公共衛生服務項目；規範基層衛生人員隊伍和技術服務；協同相關部門做好有關深化醫藥衛生體制改革辦公室工作，負責醫改統計及信息報送工作。
（八）中醫科
擬訂全市中醫藥事業發展規劃並組織實施，管理中醫、中西醫結合的醫療、教學、科研工作，組織實施全市中醫院的分級管理評審，加強重點中醫專科建設，組織對中醫藥資源的研究、開發和套用。
（九）統計信息科
負責衛生計生統計工作，推進統計台賬建設，檢查統計業務質量；承擔計畫生育獎勵優惠政策涉及對象的調查摸底、網上錄入和匯總上報工作；參與人口發展戰略相關工作與人口基礎信息庫建設工作;組織監測計畫生育發展動態，提出計畫生育安全預警預報信息建議。
（十）藥政管理科
建立基本藥物制度並組織實施，協調有關部門制定補償政策；對公立醫療機構藥品、耗材的採購、配送進行監管；負責國家基本藥物制度實施情況的管理與監測。
（十一）科技教育科
擬訂衛生計生科技發展規劃及相關政策，組織實施相關科研項目、新技術評估管理、科研基地建設，負責實驗室生物安全監督管理；參與擬訂醫學教育發展規劃，協同指導醫學院校教育，組織指導開展畢業後醫學教育和繼續醫學教育，貫徹落實國家住院醫師規範化培訓制度；組織指導衛生計生專業技術人員崗位培訓工作。
（十二）防治愛滋病科
擬訂全市愛滋病防治規劃及措施並組織實施，負責愛滋病防治工作的需求評估、預算編制、計畫安排、經費下達、信息發布、督查指導和評估考核，承辦曲靖市防治愛滋病工作委員會的具體工作。
（十三）婦幼健康和計畫生育基層指導科
擬訂婦幼衛生和計畫生育技術服務政策、規劃、技術標準和規範，推進婦幼衛生和計畫生育技術服務體系建設，指導婦幼衛生、出生缺陷防治、人類輔助生殖技術管理和計畫生育技術服務工作，依法規範計畫生育藥具管理工作；指導、檢查、督促節育手術併發症的預防、鑑定和治療；規範婦幼保健人員隊伍和技術服務。指導和督促基層加強計畫生育基礎管理和服務工作，貫徹落實計畫生育政策，推進基層計畫生育工作網路建設。
（十四）流動人口計畫生育服務管理科
擬訂流動人口計畫生育服務管理工作規劃、政策。推動流動人口計畫生育基本公共服務均等化政策的落實；指導基層建立流動人口衛生計生信息共享及公共服務工作機制。
（十五）計畫生育家庭發展科
研究提出促進計畫生育家庭發展的政策建議，建立和完善計畫生育利益導向機制及特殊困難家庭扶助制度；擬訂和審核把關計畫生育獎勵扶助政策的落實。承擔出生人口性別比綜合治理工作。
（十六）宣傳科
承擔衛生計生信息化建設，擬訂衛生計生宣傳、公眾健康教育、健康促進的目標、規劃、政策和規範；承擔衛生計生科學普及、新聞和信息發布等工作。
（十七）人事科
擬訂全市衛生計生人才發展政策，負責機關和市直單位的人事、機構編制、科級領導幹部選拔、監督、培訓教育及年度考核；組織實施全市衛生計生專業技術資格、護士執業資格考試和高級專業技術資格評審推薦工作；指導專業技術人員聘任、崗位設定、考核、人事檔案管理工作。
（十八）監察評價科
指導全市衛生計生系統的宣傳思想政治工作，貫徹落實好黨和國家的醫療衛生計生方針政策，推廣衛生計生改革與發展的理論研究成果、先進典型、經驗、做法；負責黨委的日常工作；指導全市衛生計生系統黨的建設工作；管理機關、市直單位的黨群、統戰、思想、組織、作風建設和黨員教育管理工作；協助黨委加強黨風廉政建設工作；指導衛生計生系統的工會工作和民主管理、民主監督工作。
現任領導
曲靖市衛生和計畫生育委員會主任：繆應虎
