為官經歷
嘉靖元年（1522），任河南內黃縣知縣，適外祖父去世，回鄉守喪，喪期滿，後補授華亭（今上海市）知縣。據說他在當華亭知縣期間，某年，發生大旱，又飛來大量蝗蟲，給華亭縣帶來沉重的災難。當時，方鈍急中生智效法古人，以赤腳築壇，禱告天地，以求喜雨。不久果然下了一場大雨，解除了旱災，蝗蟲也奇蹟般飛出了華亭，百姓喜得豐收，於是人們都說方鈍是福官，走到哪裡，哪裡就風調雨順。
嘉靖九年（1530），升廣西監察御史。
嘉靖十年（1531），轉任河南監察御史。推薦人才和彈劾官員都不避個人恩怨。
嘉靖十二年（1533），升山東巡撫，安撫百姓，整飭吏治。使民眾安居樂業，社會得以安定。
嘉靖二十年（1541），因督修慈慶宮、慈寧宮有功，升任大理寺丞。
嘉靖二十五年（1545） ，升任大理寺少卿。總理糧儲，積米達240餘萬擔，致使國庫充盈。為國家建立了有三十六個倉的糧庫。
嘉靖二十六年（1546），轉任大理寺左卿。後升太僕寺卿，在處理養馬監牧方面，核查實情，革除弊政，杜絕貪污舞弊行為，節省馬價白銀數十萬兩。
嘉靖二十七年（1547），升任都察院都御史。總理黃河治理工程。實地勘察，度地興工，疏鑿河道，加固提防，減緩水勢，使漕運暢通。
嘉靖二十八年（1548），轉升南京戶部侍郎，又轉戶部左侍郎。
嘉靖二十九年（1549) ， 韃靼虐通州及京郊數縣。世宗皇帝命仇鸞率兵北征，方鈍負責籌集軍餉。事平之後，仇鸞分戰功之時，方鈍堅持不受。
嘉靖三十一年（1551） ，接任戶部尚書。掌管全國賦稅錢糧達七年之久。他不避恩怨，廉潔奉公，“崇儉節用，以豐天下”。遇災荒之年，他即上奏發糧賬濟災民．魚賦稅，減徭役，解除民困，曾在皇帝面前奏準“湖南免山糧，湖北免水糧”，並在北京捐資建立岳州會館，安排同鄉宦仕居住，並訂立了三十二條條約，互相勉勵。湖南籍的京官經常在此聚會，共商興國大計。 民間至今流傳一句話“方尚書做官，提帶湖南一省人”。當時，北有韃靼，瓦剌不斷騷擾，南有倭寇，海盜侵擾，而世宗皇帝卻迷信於打醮祈禱，費用浩繁。方鈍秉公直諫，先後上書十萬餘言。對奸相嚴嵩夫子的橫行霸道和危言恐嚇，上朝議事時也敢當面駁斥，同朝高官嚇得面如土色。
後因遍戰失利，朝廷追查責任，嚴嵩怕自己受賄之事敗露，暗地奏請皇上改任方鈍為南京戶部上書，置於閒散無權之地。
嘉靖三十六年（1557） ，方鈍按照慣例以年滿七十歲而準備告官退引，但朝廷仍有挽留之意。據說當初，時任宰相的嚴嵩以六卿的官銜封為太子少保，但著玉帶一般須向上級行賄才能獲允。而方鈍卻不願效嚴嵩那種同流合污的做法，他說，行賄而得太保腰玉又何用呢？那只是圖慕虛榮。因此，他到頭來也沒有晉升為太子少保的頭銜和腰著玉帶。告老還鄉後積極籌劃家鄉水利建設。
嘉靖四十一年（1562），方鈍主持重修三眼橋。全橋為東西走向，由麻條石砌成，橋中有三孔，每孔跨徑13米，高難度15米，寬6.5米，長56米。橋面用麻石板鋪墊，兩邊護以80厘米的石欄。橋兩頭各有石獅一對，栩栩如生。全橋建築精美，構造堅固。在重建過程中，方鈍出資出力，功不可沒。並且修紫荊、楓樹二堤，民間堪為佳談，時至今日，岳陽亦流傳許多方尚書的傳奇故事和美談。
方鈍在家生活達十九年之久，巡撫、巡按上疏10多次，奏請他回朝復職。
大明穆宗即位下詔官復原職，進階一級。
方尚書墓遺址中被破壞的文官石像神宗皇帝即位亦下詔慰勞。
民間故事
移祖墳
方尚書從小就非常聰明，他母親是岳陽渭洞人，相貌很醜，背又駝，但是聰明賢惠，人家笑她是駝背，她說“她這是倒官印的模子”，方鈍剛上學一年，家裡要做喪基（岳陽的一種古老喪葬習俗，為家中在世的高齡長者修築的墓穴，洞形結構），請了一個風水先生看地。風水先生看好一片地以後，對方鈍的父母親說：“這塊寶地，風水好，葬下去三代就要出尚書”，方鈍在旁邊玩耍聽到以後，就忙對父母說：“那趕快把爺爺的墳墓遷到這裡來！”風水先生問他為什麼，方鈍說：“爺爺是一代，爹爹是一代，到我這裡是三代”，風水先生一聽非常驚奇，就對其父母說：“恭喜！恭喜！你家尚書已經出來了”，至今岳陽縣楊林等地還流傳著一句說法“向天獅子笑嘻嘻，不發渭洞發沙陂”，沙陂出了個方尚書。
勤奮讀書
方尚書少年時，不貪玩耍，終日抱書苦讀，故名鈍，字號稱謂都含有自勉和鞭策之義。青年時，方鈍善於寫文章，他的伯父方寧若，為人“守世讓愛”，視方鈍為掌上明珠。年少氣盛，頗有幾分自負，有一次，他寫了一副對聯貼在自家門前：“識遍天下字，讀盡人間書”。有一老翁看了不以為然，手捧書本“前來求教”，方鈍一看，書上的字竟一個也不識，頓時羞慚滿面。將門口的對聯亦改為“發奮識遍天下字，立志讀盡人間書”。
幫扶同鄉
有個岳陽的生意人，在南京做生意虧本了，連回家的路費都沒有。於是去找方尚書幫忙。方尚書很同情這位同鄉，給了他路費，並鼓勵他下次把虧了的錢賺回來。這位生意人嘆氣道“錢不好賺啊”，方尚書想了想便對他說：“回去以後，發動鄉鄰把山上的苦櫧摘一船到南京來”。這商人百思不知其解，心想這苦櫧值什麼錢，誰會要？但是既然是方尚書說的就不會錯。回去照辦去了。
沒過多久，果然一船苦櫧到了南京，方尚書立即替他寫了一張告示。寫道：湖南調來一船櫧，一消氣來二補虛。二兩銀子買一顆，錯過機遇莫道時。還蓋上方尚書的官印。這下南京城裡做官的，行商的都搶著來買。一船苦櫧銷得精光。
平生四足
湘北巴陵郡有位著名的才子叫方鈍，字仲敏。他出身貧困，寒窗苦讀，後來赴京城應試中了狀元，被當朝天子賜進士及第。並賞賜給方鈍銀兩，要他回家蓋一座漂亮的府第，還傳旨要給他娶一個年輕美貌的官家小姐。方鈍一聽，連忙跪地，不肯接受皇上的賞賜。皇帝問他為何不願領命？方鈍坦誠地說：“臣平生四足矣，實不敢領旨”。 皇上感到愕然，問他哪“四足” ？方鈍答道：“茅房是吾居，雕樑畫棟我不想，風雨不漏足矣；粗餚是吾食，山珍海味我不想，一日三飽足矣；醜婦是吾妻，俏麗美女我不想，糟糠賢惠足矣；蠢子是吾兒，妻離子散我不想，仁慈孝順足矣。”皇帝聽後，非常讚許，當即收回成命，並詔旨任他為朝廷為官。
苦蕎和苦修三眼橋
相傳方鈍奏請朝廷重修三眼橋，因國庫下撥款銀有限，官吏層層剝削，民工吃稀飯小菜，食不飽肚，都向方尚書訴苦，工程進展也受阻。當得知欽差大臣和岳州府台將到三眼橋來踏看的訊息以後，方尚書便吩咐把苦蕎做的粑粑拿出來吃。當欽差大人到達工地，適逢民工用餐，見老方尚書和民工吃的都是黑糊糊的粑粑，從方鈍手中接過一塊粑粑咬了一口，又苦又澀，難以下咽，才知這種粑粑是用苦蕎做成的，十分感慨地說，方大人吃苦蕎，真是苦苦修橋啊！欽差大臣回京上奏皇帝，特撥一筆銀元犒勞修橋之人。這“苦修三眼橋”的故事至今仍在岳陽傳為美談。
減免湖南湖北糧稅
方尚書告官退引於岳陽，然則身隱於市，心卻系蒼生。有感岳陽城區通商不便，主持重修三眼橋，民間美談無數。方尚書有感糧稅過重，民間疾苦。令人到洞庭湖捕撈洞庭銀魚，又令人採摘岳陽名茶君山銀針，進獻宮廷。洞庭銀魚若無骨無腸而呈半透明狀，既肥嫩，又鮮美；君山銀針沖泡時，棵棵茶芽立懸於杯中，三起三落之，極為美觀，品之清香一縷，心曠神怡。皇上龍心大悅，遂下旨：“湖南免山糧，湖北免水糧。”民間至今流傳的一句話：“方尚書做官，提帶湖南一省人。”
深遠影響
修橋功高
方尚書告老還鄉後造福鄉里的心血—三眼橋方尚書苦修的三眼橋，已有四百多年的歷史，一直到1995年橋上穿越的都是湖南省省級公路。任憑風吹浪打，滄海桑田，三眼橋不裂不損。老尚書功不可沒，後人為銘記其功勞，將其遺骨葬在三眼橋對面的螺絲山中，每當夕陽西下南湖的時候，三縷陽光從橋洞中穿射在方尚書墓上，寓意“日受千人拱手，夜觀萬盞明燈”，表示對他的尊敬和懷念之情。
螺絲山尚書墓遺址中的武將石像1996年，岳興公路改修，新建南湖大橋落成。南湖大橋碑記上也寫著，本橋採取鋼筋大拱橋式結構，以向昔時方尚書行萬世拱手之禮。如今二橋並肩而立，一橋年輕，一橋古老。成為南湖上獨特的風景。
文脈延綿
方尚書是土生土長的岳陽人，是岳陽翰林街上八位翰林之一。24歲進入岳州府為生，後轉為稟生，也是岳陽古時傑出的人文代表之一。在當年岳陽師範學院（現湖南理工學院）建院選址的時候，就選定在三眼橋邊，遙對螺絲山方尚書墓。如今湖南理工學院已經發展成為一所文、理工為主,經、管、法等學科並重,師範教育優勢明顯,立足湖南、面向全國的多科性全日制本科高校。數千莘莘學子，日夜朗朗書聲響徹南湖之濱，常伴方老尚書千古，湖湘文脈一脈相承，延綿不斷。
方鈍墓
2013年8月30日，位於岳陽城區三眼橋北螺絲山的明朝方鈍墓，經過考古隊員19天來的考古發掘，墓圍、墓廬等建築遺蹟清晰可見，基本判定為岳陽目前發現的最大尚書墓，工作人員表示，預計通過一周，墓葬的整體布局就會全面呈現。方鈍墓現已納入城市開發建設範圍，為了保護方鈍墓免遭建設破壞，根據《中華人民共和國文物保護法》和岳陽市委、市政府的要求，岳陽市文物管理處將對方鈍墓進行文物考古調查勘探，為方鈍墓制定保護規劃提供科學依據。“我們已將石人、石馬運至岳州文廟進行保護。”勘探現場，岳陽市文物管理處副研究員羅仁林告訴記者，從目前的挖掘情況判斷，墓圍殘長20多米，面積為500平方米，是岳陽現存三大尚書墓(嚴尚書、謝尚書、方尚書)中最大的一座。
方尚書墓遺址的石碑