專家治校
校園一角聘請中國教育學會常務副會長郭振有、北京師範大學教育學院副院長劉復興、南京市教育局長徐傳德、衡水市教育局長李金池、原江蘇洋思中學校長蔡林森、上海建平中學校長程紅兵、西北師範大學教育學院院長李瑾瑜等專家為顧問。
校長慕政重，北京師範大學教育經濟與管理專業博士生，中學特級教師，享受國務院特殊津貼專家，全國教育系統勞動模範、全國模範教師，全國中學十大傑出校長，紀念改革開放30年基礎教育教學管理傑出人物，全國基礎教育系統先進工作者，甘肅省“園丁獎”獲得者，甘肅省骨幹教師，慶陽市跨世紀學術技術帶頭人“185”拔尖人才，慶陽市教育名師，慶陽市十佳校長、功勳校長。兼任政協慶陽市委員會常委，慶陽市教育管理研究會副理事長等職務。
科學管理
慶陽二中承辦全國中學校長論壇2007年學校被評為“全國精細化管理示範學校”，2008年學校被評為“全國深化實施素質教育典型學校”。獲西峰區“高考優勝”、“教育工作先進集體”獎勵，2009年獲全市“中學高考質量一等獎”，連續幾年被評為西峰區“先進基層黨組織”稱號。
構建精細化的現代管理新機制。實施“條塊管理，以塊為主，動態管理、節點考核、量化激勵”的精細化管理體制,將過程管理和終結管理相結合，讓評價激勵機製成為生產力，成為內驅力。
構建生本化的課堂教學模式。創立以“落實主體、注重雙基，精講多練，當堂作業”為教學原則的“二四五”教學模式，開設校本課程，面向全體，減負提質。
構建校本化的教研體系。開展“自主管理”、“議教議學”、“一帶五課”等研究活動，推行“帶教導師制”，以課程研究和“四個論壇”為依託，推進師資隊伍建設。
特色辦學
中新友好班簽字儀式成立國際部，開設“中國－紐西蘭友好實驗班”、“中澳班”、“國際班”，與國際教育接軌，開展對外教育交流合作，並與國家留學基金管理委員會留學預科學院合作建立出國留學人才選拔基地，共同培養國際性複合人才。使教師接受最新國際教育理念，使學生享受優質國際教育資源，真正實現與國際先進教育接軌。
全面推行素質教育，實行學生自主化發展。學校開展“自主教育，自主學習，自主管理，自主發展”行動和課題研究，自上而下分別成立了各級學生自主化管理組織，鍛鍊了學生能力，提高了學生素質。
學校建有體藝中心，承擔並舉辦校內外各類體藝教育活動，廣泛開展第二課堂教學活動，促進學生全面發展。
打造激情燃燒的學習樂園，構建奮發向上的精神特區。通過創新機制、營造環境、服務師生等措施調動教師激情，通過課間唱、課間跑操、舉辦校園文化藝術節、創建文化長廊等活動，讓校園朝氣蓬勃，異彩紛呈。
質量強校
校長慕政重科學引領，以人為本，以德為先，民主治校，科研興校，使學校教育教學質量實現跨越式發展。2006年二本以上上線201人，突破200人大關，較上年增長40%。2007年二本以上上線476人，較上年增長137%，占全市增長人數的84.6%，其中2名學生考入清華大學，填補了歷史的空白。2008年二本以上上線544人，其中6名學生進入全市文、理科前10名，其中文科學生孫韜洋奪得全市第1名。2009年高考二本以上上線人數首次突破700人大關，達到749人，其中文科學生席永卓、朱磊磊分別奪得全市第1、2名。應屆學生升學率居全市省、市級示範性高（完）中第一名後，2010年高考二本以上進線率居慶陽市高（完）中第一名，二本以上進線人數比09年增長20%；國際部應屆班二本以上文化課考生上線61人，上線率達到52%，其中一本文化課上線率達到33%；全校應、往屆高考二本以上進線人數685人，2011年高考二本上線較去年有四個增長：①總人數710人，增加25人；②文化課上線544人，增加18人；③專業課上線166人，增加7人；④應屆生上線163人，增加12人。使慶陽第二中學的高考二本以上上線人數實現了每年平均遞增近200人的“四級跳”，創造了“三流生源，一流質量”的奇蹟，使慶陽第二中學一躍成為名校。
