校史
1994年10月“慈濟醫學院”創校。
校徽1998年8月 更名為“慈濟醫學暨人文社會學院”。
2000年8月 改名為“慈濟大學”，包括醫學院、生命科學院、人文社會
學院及教育傳播學院。
2000年 “慈濟大學附屬高級中學”及“慈濟大學實驗國民國小”正式創
校。
2002年 “慈濟大學實驗國民國小附設幼稚園”創校。
2007年9月 新增人文社會學院校區。
2011年8月 “慈濟大學附屬高級中學”及“慈濟大學實驗國民國小”合併為“慈濟大學附屬高級中學”（含高中高、
國中部、國小部、附設幼稚園）
2011年10月 校名更名為“慈濟學校財團法人慈濟大學”。
教學研究單位
醫學類
醫學系
醫學研究所
護理學系暨研究所
公共衛生學系暨研究所
醫學檢驗生物技術學系暨研究所
醫學資訊學系暨研究所
微免暨生物化學研究所
生理暨解剖醫學研究所
臨床醫學研究所
藥理暨毒理學研究所
物理治療系
學士後中醫學系
生命科學院
生命科學系暨研究所
分子生物暨人類遺傳學系暨研究所
教育傳播學院
教育研究所
傳播學系暨研究所
兒童發展與親職教育學系
師資培育中心
人文社會學院（介仁校區）
宗教與人文研究所
社會工作學系暨研究所
人類發展學系暨研究所
英美語文學系
東方語文學系
社會地位
慈大的學門發展主軸明確，即醫學、生命科學、社會人文、教育傳播四大領域，在台灣各具其影響力。並擁有台灣唯一的：傳播學系具有大愛電視台輔助的教學見實習系所。
迄2012年，慈大姊妹校已包括中國大陸名校北京大學、上海交通大學、中山大學；港澳名校香港大學；歐美名校伯克利大學；東南亞名校馬來亞、朱拉隆功等。
學術獨立
慈濟大學雖由佛教慈善團體創立，但教職員生仍享有台灣“憲法”第十三條所保障之宗教自由，學生社團亦有聖經真理生命社、儒學社、觸愛團契等，現全校絕大多數皆非慈濟人。
研究中心
原住民健康研究室
運動員藥檢中心
古人類DNA研究室
實驗動物中心
自主神經研究室
社團活動
目前共有6個大類：“學生自治組織”、“學術、藝術性”、“服務性”、“音樂性”、“聯誼性”、“體育性”，2010年底總計56個學生社團，其中不乏表現優異者。（僅計入日間部登記在案者，不含校隊、進修部、各系學會下屬校隊社團）。
國樂社：“九十五學年度全國學生音樂比賽-大專團體組絲竹室內樂合奏”優等第一名
合唱團：“2007全國大專院校音樂比賽北區優等”
慈青社、天文社：“2007年全國大專校院績優學生社團評鑑暨觀摩活動”優等獎
歷任校長
1993年02月至2000年05月 第一任 李明亮（前台灣“行政院”衛生署署長）
2001年03月至2002年07月 第二任 藍忠孚
2002年12月至2005年11月 第三任 方菊雄
2006年03月至今 第四任 王本榮
附屬學校
附屬中學：慈濟大學附屬高級中學
附屬中學國小部與幼稚園：慈濟大學附屬高級中學國小部（附設幼稚園）
教育與研究
進入ESI學門排名
高等教育評鑑中心公布國內大學ESI學門排名(2009.05)，全台灣171所大學僅31校進入ESI學門排名，進入ESI排名即表示進入世界前1%。慈濟大學進入ESI全球排名之學門有以下一門。
| 學門 | 論文數全球排名 | 引用數全球排名 | 論文數台灣排名 | 引用數台灣排名 |
|---|---|---|---|---|
| 臨床醫學 | 1499 | 2628 | 12 | 12 |
進入WOS排名全台前15大
依據台灣“財團法人高等教育評鑑中心基金會”公布的2004年至2009年WOS（Web of Science）收錄SCI期刊當中各學門論文數與被引次數表現在台灣前15的學校名單統計，慈濟大學一共有6個學門列入前15名，其中4個學門在IF平均積分項目上列入前五名。其中“期刊影響係數（IF）”平均積分統計結果，神經科學與行為學IF平均積分全國排名第2，臨床醫學學門IF平均積分台灣排名第2，精神病學與心理學門IF平均積分台灣排名第3。
| 學門 | 論文數排名 | 總引次數排名 | IF平均積分排名 |
|---|---|---|---|
| 臨床醫學學門 | 11 | 11 | 5 |
| 分子生物學和遺傳學學門 | 14 | 14 | 11 |
| 生物學學門 | 14 | 15 | 15 |
| 神經科學 和行為學學門 | 8 | 6 | 2 |
| 藥理與 毒理學 學門 | 14 | 13 | 2 |
| 精神疾病 / 心理學學門 | - | 8 | 3 |
網路學術影響力
依據西班牙國家研究委員會網路計量研究機構“Webometrics”的研究顯示，截至2011年1月為止，慈濟大學位列台灣156所大學第30名，全世界第821名。
教研成果
企業最愛畢業生
依據《Cheers快樂工作人雜誌》的“2008年台灣1000大企業最愛大學畢業生”調查顯示，慈大“生命科學院”排名全國第5名，僅次於台大，清大，成大及陽明。
醫學院國考合格率
2006年醫師高考及格率96％（全國平均及格率72.10％），護理師高考89.2%（全國平均及格率31.42％），醫檢師（73.17%全國平均及格率41.36%）。醫學院國考及格率年年優於平均值外，其中數年更居於全國及格率榜首
2002 第二階段87%優於整體平均71%
2002 高考31%優於整體平均18%
2003 第二階段100%優於整體平均70% （榜首）
2003 高考85%優於整體平均48%
2004 高考90%優於整體平均66%
2005 高考91%優於整體平均73%
2006 高考96%優於整體平均72%
2007 醫師（二） 100%優於整體平均98% （並列榜首）
2007 醫師（一） 82%優於整體平均59% （榜首）
2007 醫師 85%優於整體平均50%
教學卓越計畫
在中華民國教育部95、96學年度“教育部補助重要特色領域人才培育改進計畫”當中，慈大獲得新台幣近3000萬元的補助，總額在33所獲款大學中為全國第8名。
大學新生註冊率
96學年度大學部註冊率92.25%（95年為90.43%），研究所註冊率92.77%，遠優於平均值82%。
高教評鑑通過率
評鑑年度為：98學年度下，與台灣大學、台北大學、中正大學同期評鑑，評鑑結果除兩研究所新增設仍待觀察外，其餘系所全數通過。
2010年2月教育部全國私校體育評鑑獲“一等”
慈大體育師資相對充沛、體育選修課程完善、運動場地充足（游泳池、室內外運動場、健身中心、羽球場等），讓慈大的體育在軟硬體都有高度評價。
交通
校本部校區
位於花蓮市中央路三段與莊敬路交叉口，鄰近有花蓮車站及花蓮機場。
人文社會學院校區
位於花蓮市介仁街上，大門對面為慈濟大學附屬高級中學（國小部）大門，臨近碧雲莊社區、達固湖灣大路。
宿舍
校本部校區
為四人一間，房內有衛浴設備。
公共設施：各層有室內曬衣場（洗衣機、脫水機）、簡易廚房、讀書室，並有戶外大曬衣場，舍外有機車停車場。
人文社會學院校區
為四人一間，房內有衛浴設備，室內外曬衣陽台。
公共設施：販賣機、公用大冰櫃、洗衣間（1間）、簡易廚房（冰櫃、電鍋、電視、沙發組）、自修室，靠近達固湖灣大路，設有戶外汽機車停車場（機車有遮棚）。
餐廳
校本部校區
校內餐廳提供低廉價格的早中晚餐素食，校外即有7-11及各式餐廳、便當。
人文社會學院校區
校內餐廳提供低廉價格的早午晚餐素食，周六日休息，但有提供訂餐服務。
校外餐飲需步行（十分鐘左右）至介仁街與建國路二段交叉口，有餐廳、便當店、飲料店、便利商店、市場（早）。
