歷任所長:蘇步青(1956-1986年)、谷超豪( 1986年始)、洪家興.該所的創辦宗旨是:為國家培養高級數學人才和承擔國家重點科研項目(現代數學的理論和方法)的科研任務.該所在1964年增加了專職編制,開始設立微分幾何、函式論與泛函分析、微分方程、機率論與數理統計等4個研究室.“文化大革命”中被迫解散.粉碎“四人幫”後,在黨和國家的親切關懷下,在所長蘇步青教授領導下迅速地恢復了微分幾何、泛函分析(包括函式論)、微分方程(常微和偏微)、機率論與數理統計、套用數學(計算數學、控制論、運籌學)等5個研究室.1978年春季在全國率先恢復招收研究生,現在該所已建立了博士後流動站.1980年起,受國家教委的委託,負責創辦了《數學年刊》,1983年起又分(A>, (B)兩輯出版,其中(A)輯為中文版,<B)輯為英文版.<B)輯已被列為美國科學引文索引(SCI )世界核心期刊中純數學期刊,(A)輯也由美國阿倫頓出版公司翻譯為英文在美國發行.
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