町村制以前
明治維新之後、日本政府為了建立中央集權的國家，開始著手變更地方行政制度，在1871年先制定了大區小區制，並在隔年開始實施，但此制度並未考量各地狀況，未能順利推行。1878年日本政府制定“地方三新法”，確定了地方行政制度的架構，包括“府縣”、“郡區”、“町村”的三級架構，之後陸續1888年實施市制和町村制。
島嶼地區
在1888年實施市制和町村制時，島嶼地區被排除在外，不視為本土，另設定“島廳”由各地府縣直接管轄；直到各地陸續實施“島嶼町村制”，或是取消島嶼指定狀況，視為本土並施行“町村制”之後，各島嶼地區才開始設定町村。伊豆群島及小笠原群島
由於人口較少，且小笠原群島上有來自歐美的居民，因此最初由東京府直接管轄。- 1876年：足柄縣被廢除，併入靜岡縣。
- 1878年：改隸屬東京府。
- 1900年：伊豆群島上設定大島島廳、八丈島廳，小笠原群島設定小笠原島廳。
- 1923年：伊豆群島開始實施島嶼町村制施行。
- 1926年：廢止島廳制度，將其改組為支廳。
- 1940年：小笠原群島開始實施島嶼町村制。
隠岐群島
隠岐群島上最初曾設定海士郡、知夫郡、周吉郡、穩地郡四郡，並設定郡役所負責行政之管理；直到1889年廢除四郡，設定隠岐島廳，隸屬島根縣管轄。對馬島
- 1869年：隠岐國改設定隠岐縣，後又被併入大森縣。
- 1876年：經過多次縣的合併之後，最後決定隸屬島根縣管轄。
- 1889年：廢止隠岐群島四郡，設定隠岐島廳。
- 1904年：取消島嶼特例，視為本土，實施町村制，島廳的許可權變更為與本土的郡役所相同。
- 1925年：廢除隠岐島廳，改設隠岐支廳。
- 1889年：設定14村。
吐噶喇群島及奄美群島
- 在設定鹿兒島縣後，奄美群島就屬於縣府直接統治，而島廳之下的地方行政單位則是延續過去琉球王國施行的間切，替代町村的設定。
- 1879年：實施郡區制和町村制，在奄美群島設定大島郡，隸屬大隅國，並設定郡役所，地名全名為鹿兒島縣大隅國大島郡。
- 1885年：廢止郡役所，改設金久支廳。
- 1886年：金久支廳改名為大島島廳，支廳長改設為島司。
- 1897年：薩摩國川邊郡的島嶼地區（硫磺島、黑島、竹島、口之島、臥蛇島、平島、中之島、惡石島、諏訪之瀨島、寶島）改編入大島郡。
- 1908年：實施島嶼町村制，廢除間切。
- 1920年：解除島嶼特例，視為本土，改實施町村制。
- 1926年：島廳改設為支廳。
沖繩縣
- 明治時代最初沖繩縣仍延續琉球王國時期的行政，施行間切制。
- 1872年：琉球王國被日本併吞，設定琉球藩。
- 1879年：廢止琉球藩，改設定沖繩縣。
- 1896年：設定島尻郡、中頭郡、國頭郡、宮古郡、八重山郡五郡以及那霸區、首里區，並在宮古群島和八重山群島設定島廳。
- 1908年：實施島嶼町村制，廢除間切制度。
- 1920年：解除島嶼特例，視為本土，改實施町村制。
