山本出生於1819年，日本愛知縣美浜町。14歲當上了海員。有一次，他乘坐的船遇上大風浪，漂流了一年多後抵達北美洲。後來，他到過英國、澳門和上海工作，1862年來到新加坡從商，還娶了本地女子為妻。
山本音吉在1867年病逝，死後埋葬在新加坡武吉知馬基督教墓園。
1819年（文政２年）尾張國知多郡小野浦村（現美浜町）出生。
1832年（天保３年）乘搭千石船・寶順丸向江戶（今東京）行駛，與乘組員在遠州灘沉船。在海上漂流１４個月後，到達美國西海岸。
1834年（天保５年）經過１４個月的漂流後，僅三人生存，此三人為音吉、久吉和岩吉，他們到達美國華盛頓州，並在當地接受英語教育。
1835年（天保６年）在澳門完成世界第一本日本語版聖經的翻譯。
1837年（天保８年）乘搭美國船隻返往日本，當時美國船隻遭到幕府炮擊，因此前往上海定居。
1854年（安政元年）日英和親條約締結時，任英語和日本語的翻譯員。
1862年（安政９年）抵達新加坡，是第一個在新加坡定居的日本人
1864年（元治元年）由於日本的鎖國政策，無法返國，因此入籍英國。
1867年（慶應３年）49歲在新加坡的實乞納去世，實乞納也是山本音吉在新加坡的住所。
新加坡日本人協會在1994年受美濱町的町長齋藤宏一町長所託，協助尋找音吉在新加坡的足跡。
由於新加坡的武吉知馬基督教墳墓因為受發展計畫影響，已在1970年代被清理。山本音吉的骨灰當年無人認領，當局因此把它轉移到蔡厝港基督教墳場。
2004年2月，新加坡日本人協會和新加坡環境局的合力下，找到了山本音吉的埋葬地。
為紀念山本音吉，新加坡日本人協會將在星期六2005年2月18日的新加坡妝藝大遊行里，呈獻以音吉為主題的歌舞表演。他的骨灰也將在這天，從新加坡被運回家鄉──日本愛知縣美浜町。值得一提的是，他的骨灰將被一分為二，一半給他在日本的後人保留，另一半則留在新加坡，存放在楊厝港的日本人公墓內，紀念他在獅城生活的一段歷史。
