產生原因
患者在行造血幹細胞移植時，在造血和免疫功能重建之前，由於大劑量化放療，幾乎摧毀了患者的造血功能和免疫防禦系統，全血細胞缺乏的嚴重免疫缺乏狀態，病人處於骨髓衰竭，極易發生各種感染及其他併發症。各種病原菌感染是造血幹細胞移植中最常見的併發症，也是造血幹細胞移植死亡的主要原因之一。根據這一特殊性，對病人實施全環境的保護隔離，也就是需要在專門的造血幹細胞移植病房——也稱無菌空氣層流病房內進行。而空氣層流室則是一個相對無菌的病房，包括空氣也是經過高效濾過，其內所有物品也經過消毒滅菌處理。利用這個無菌環境減少污染的機會，幫助移植成功。由於該病房要求消毒無菌較普通病房嚴格，出入病房都有相關規定，所以給患者特別是家屬陪伴帶來不便，但通過電話、探視窗及監護螢幕是能與親屬保持聯繫的。
無菌環境的維持
病房經過清潔消毒後，再送入經過高效過濾器過濾的層流空氣，以此實現無菌環境，並非是一件難事。但是，在我們身體上寄宿著無數的細菌，儘管在入室前經過各種嚴格的前處理，仍不可能將人體變成無菌狀態。
建設標準
2015年實施的《綜合醫院建築設計規範》（GB51039-2014）中，對無菌病房的空氣潔淨度（治療期血液病房應選用I級潔淨用房，恢復期血液病房宜選用不低於II級潔淨用房）和工作區截面風速等做了規定。
美國建築師協會（AIA）在2001年版的醫院與保健設施設計的建設指南中，已用“無菌病房”稱謂。而是將之歸類在防護環境病房（ProtectedEnvironmentRoom）中。 美國CDC（疾病管理預防中心）和 HICPAC（醫療感染管理諮詢委員會）則勸告，不要在新建的保護環境室中使用層流空調系統（Laminar air flow systems） 並提出了如下具體要還求：
●送風系統在中央或末端，配置高效過濾器（HEPA）。
●必須是氣密室。
●保證每小時大於12次換氣。
●送風口送出的潔淨空氣橫斷病床形成單一方向性氣流，從房間的另一側被排走。
●對前室或走道維持5Pa以上正壓。
●配置日常監視系統，記錄監視結果。
●全部病房出入口均需配置自動門。
