幽門螺鏇桿菌的診斷可大分為二大類,一類是侵襲性的檢查法,是經由胃鏡取胃黏膜檢體做尿素檢測,病理學檢查及細菌培養。這種方法最大的好處是可以做種種檢測確認培養出來的細菌就是幽門螺鏇桿菌,而且可以分析各別菌株毒性強弱及對抗生素抗藥性的有無,對使用那一種殺菌藥物組合的選擇可以有所幫忙,另外更可以在胃鏡檢查時查看胃內是否有其它的病變如 胃癌 、胃淋巴瘤等,而最大的缺點是必須使用胃鏡檢查,有些病人有胃鏡恐懼症而無法接受這樣的檢查。另一類的檢測方法為非侵襲性,包括尿素氮呼氣試驗、血清檢查、大便中幽門螺鏇桿菌抗原的檢測及尿液檢查。
最近,由於生化科技的進步,己經研發出一些新的檢測方法(糞便HPSA及尿液URINELISA檢測),由酵素免疫分析法來偵測糞便或尿液中是否有幽門螺鏇桿菌的存在。
尿液幽門螺鏇桿菌的檢測是一個準確、簡單、快速、便宜,又不具侵襲性的檢查,不受病人年齡,是否配合等因素影響,所以可以套用在大人、小孩、植物人、放呼吸器的病人、甚至完全不合作的精神病人。也可以套用在新鮮或冷凍的尿液,更可以目測法來判定結果。所以尿液幽門螺鏇桿菌的檢測是一個可以用在診斷或大規模篩檢幽門螺鏇桿菌感染情況的一個新利器。
和血清檢查一樣,它的缺點是即使幽門螺鏇桿菌已被消除,抗幽門螺鏇桿菌抗體卻仍然會持續六個月以上甚至達到一年才會消失,所以沒辦法直接反應現在幽門螺鏇桿菌感染的情形。所以在未曾接受過幽門螺鏇桿菌根除療法病人可以當成起始的診斷方式,而在成功的根除幽門螺鏇桿菌之後,抗體效價會逐漸下降,但是直到數年後並不一定會降到零,就因為抗體效價會持續一段時間,所以幽門螺鏇桿菌抗體測試的方法不應該用於檢測病人幽門螺鏇桿菌是否已被根除。
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