《小探索者》內容淺顯易懂，既注重科學知識的前瞻性，又注重少兒所學知識的互補性；形式上圖文並茂，插圖新穎，強調以圖說話，讓孩子讀起來更輕鬆，看起來更悅目。
欄目設定
以故事的形式，講述那些人類並不完全了解的神秘世界。水怪、盜墓、UFO……在懸疑、童真的科幻故事裡，為孩子講述科學知識。
可怕的科學
最天真的科學異想，最有趣的配圖。讓孩子們在異想中獲得真知，開啟想像的空間。
歪趣書本
將國小階段的語文、數學、外語、科學等科目的知識內容，以科學知識的角度重新包裝，對教材做一次補充和延伸。
非常科學
關注社會熱點、時事熱點，從中尋找小讀者最關心的話題，從背景、內容上為讀者提供最有趣、有新鮮的知識。
擦掉問號
歷史、生物、地理等方面未知知識的趣味解讀。
動感特區
從影視、動漫等角度切入科技世界。
拆解王
對兵器、航母、載人飛船等小讀者感興趣的東西進行拆解，滿足其好奇心。
魔幻空間
為讀者講述魔術的操作“內幕”。
奇思妙想DIY
動手、實驗……這個欄目為孩子們提供一個動手操作的空間，為他們提供便於操作的示範。
闖關族
用動漫人物做引子，設定闖關環節。
校園漫畫
爆笑校園故事，最接近校園生活的語言，最幽默的語言。
互動版
讀者電腦繪畫、手工繪畫、科幻作文等原創內容刊登。
封面欣賞
欣賞指導
《小探索者》倡導“悅”讀理念，即快樂閱讀。理解能力強的青少年可以自己閱讀，在快樂中學習知識。而閱讀能力低的，我們提倡親子閱讀，讓家長和孩子一起閱讀，共同體會學習的快樂和知識的趣味。
特色打造
作為科普類讀物，《小探索者》的特色打造也充滿了科普味道。3D，讓讀物立體起來
從第一期開始，《小探索者》就奉送了3D的立體知識專題，並且贈送了立體眼鏡的製作材料和製作圖紙，全力打造以3D為特色的讀物。
此後每期的內容插圖裡，《小探索者》都精心製作了許多3D圖片供讀者欣賞。讓讀者以立體的方式體驗科學，發現樂趣。
動手又動腦，強力DIY
《小探索者》在每期的內容安排上，都精心準備了讓讀者動手參與的欄目，魔術、手工製作等內容令讀者在閱讀的過程中有看有玩，樂趣無窮。
社會關注
《小探索者》自創刊以來，得到了社會各方面的關注和支持。2010年12月17日，航天英雄楊利偉特意為《小探索者》撰寫了寄語，並與《小探索者》編輯和小記者進行了座談。
公益活動
《小探索者》為了加大科普力度，儘快實現應試教育向素質教育的轉變，已經啟動了公益活動計畫——滋潤幼苗計畫。歡樂大講堂
作為滋潤幼苗計畫的第一步，《小探索者》推出了科普系列公益講座——歡樂大講堂，把科普的歡樂帶到了每一所校園，帶給了每一個孩子。
