機構職能
密山市水務局主要負責全市水域、水資源和水工程管理、農田水利基本建設、城鄉供水、節水、水土保持、河務管理、水行政執法及防汛抗旱日常工作，為全市經濟社會的發展提供水事服務，保障用水安全，促進人水和諧。領導分工
局長帥剛，主持水務局全面工作，主管財務、人事工作，主管全市水務工程建設工作，對市委、市政府負全責。黨委書記齊曉春，負責水務局黨委全面工作，主抓黨建、精神文明建設、幹部隊伍建設工作。
黨委副書記兼紀檢書記郭忠錄，協助黨委書記具體做好水務系統黨建、精神文明建設工作，負責水務系統紀律檢查工作、普法等工作。
常務副局長婁桂蘭，負責機關日常政務工作，負責機關各股（室）及有關單位的協調、督查及聯絡接待、社會治安綜合治理、信訪、計畫生育、工作，主抓農村飲水安全、水務勘測設計和水土保持工作。
業務副局長陶樹，主管全市基層水利站、防汛、抗旱、農村水利建設工作，負責管理河道、水庫和招商引資等工作。
綜合經營副局長吳貴波，主管水務局所屬企業、水資源管理及安全生產工作。
內設機構
1、辦公室：負責機關電文、會務、政務信息、機要、檔案、保衛、保密、信訪工作；負責機關日常工作的協調和監督；承擔政務公開、新聞發布；負責機關和直屬單位的機構編制、人事管理工作；負責教育培訓和人才隊伍建設；負責水利體制改革有關工作；負責離退休工作。2、財務審計股：擬定市級水利部門預算；負責全市水利系統財務人員業務培訓工作；承擔中央和省級水利資金以及市級水利國有資產的監督管理工作；提出有關水利價格、收費、信貸的建議；負責局機關財務、國有資產管理並指導局屬事業單位的財務管理工作。組織對局屬事業單位財務收支進行審計監督；負責對中央和省以及市級水利資金的使用管理進行審計調查。
3、市人民政府防汛抗旱指揮部辦公室：組織、協調、監督、指揮全市防汛抗旱工作。負責重要應急抗旱水源工程建設，對穆稜河、青年水庫等重要水工程實施防汛抗旱調度和應急水量調度；負責防汛抗旱應急指揮系統平台建設與管理；編制市防汛抗旱應急預案並組織實施；負責全市水旱災情統計上報。
負責制定全市水務建設發展規劃及年度計畫，並組織實施；負責對全市水務建設進行投資、投勞調查、管理和使用；組織民眾開展民眾性農田水利建設，負責灌溉管理、用水調度、水田發展、科技推廣；負責水費徵收、上繳、使用和管理；負責水利工程的計畫實施、工程驗收、統計工作。負責組織制訂全市農村飲水安全建設發展規劃並組織實施；指導全市農村水利社會化服務體系建設。
4、水土保持辦公室：貫徹執行國家和省、市有關水土保持的法律法規、方針政策，並依法實施監督；負責制定全市水土保持規劃和專項措施，並組織、審擬和監督實施水土保持方案；組織水土流失的監測；負責收繳水土保持資金、水土流失防治費；協調處理因水土流失危害造成的糾紛和重大賠償責任問題。
5、政策法規辦公室：負責水利方面綜合調研和有關政策擬定工作；承擔有關規範性檔案的合法性審核；負責組織水政監察、水行政執法和監督工作；負責涉水法律、法規、規章和規範性檔案的組織實施和監督檢查；負責水行政複議、行政應訴和普法宣傳教育工作；負責城鎮供水工作、城鎮水資源管理工作及全市供水的水源規劃工作；負責指導和監督全市計畫用水，節約用水工作。
直屬單位
1、密山市河務管理處：負責《黑龍江省河道管理條例》的組織實施和監督執行，負責本市轄區內的河道（包括湖泊、人工水道、行洪區、蓄洪區）管理工作；負責處理各部門在用河方面的矛盾及河道業務技術指導；負責會同相關部門編制河道流域規劃、河道整治規劃；負責對河道管理範圍內的采砂、取土、淘金等經營活動的管理。負責徵收、管理和使用防洪保全費。2、水政水資源辦公室：負責對密山行政區域內的一切形態的地表水、地下水實行統一規劃、統一管理，貫徹執行國家的和省市有關水管理和各項方針、政策、法律、法規、條例，負責起草水資源管理的地方性法規；負責制定密山市水資源管理的各項規劃，審批密山行政區內地表水、地下水資源的開發利用，審定城鄉、廠礦、機關、企業及民用建築等開發利用水資源量；負責根據水資源條件和用水部門需要，對水資源實行統一調配。負責供水計畫和調配用水方案的編制；負責水資源的節約和保護工作。負責密山市行政區域內的企事業和駐市單位以及鄉鎮的取水、用水單位和人個的水資源費的收繳；負責取水申請受理、取水許可的審查和決定。
3、水政監察大隊。負責國家和省、市頒布的水事法律、法規的宣傳、貫徹和實施；依法對各種水事活動進行監督檢查，負責密山市內所有水事案件的立案查處，水事秩序的維護及跨鄉鎮的水事糾紛的調解工作；依法保護水、水工程和其它有關設施；對系統內各項收費進行監督檢查；承辦行政複議、應訴，配合公安機關查處水事治安和刑事案件。
4、青年水庫管理處。負責青年水庫工程全面管理，配合有關部門組織指導與水庫相關的防汛、抗旱、水土保持等工作；管理水庫範圍內的水資源，生態環境及工程設施的養護工作。
5、密山市水利勘測設計處：負責工程勘測設計、規劃設計、工程經濟概預算、水利工程設計技術諮詢、水利工程監理、水利工程施工、水利工程服務等。
