全省共有16個港口,包括安慶港、蕪湖港、馬鞍山港、合肥港、蚌埠港5個主要港口,池州港、銅陵港、滁州港、淮南港、六安港、阜陽港、亳州港7個重要港口以及宿州港、淮北港、宣城港、黃山港等4個一般港口。2016年,初步統計全省擁有生產用碼頭泊位數1148個,泊位碼頭長度82437米,其中10000噸級及以上泊位數17個。
《規劃》提出,圍繞國家實施“長江經濟帶”“一路一帶”等重大發展戰略,構建統一的沿江港口營運管理平台,深化與上海港、寧波港、南京港戰略合作。引導大型公用碼頭和液貨、LNG等專業碼頭髮展,抓住引江濟淮工程的重大發展機遇,加快合肥港公用碼頭建設以及長江、巢湖、新安江等重要旅遊景區、庫區旅遊碼頭建設。