1325年 他在拜占庭貴族的支持下，迫使安德羅尼卡二世承認他為同朝皇帝，統治色雷斯和馬其頓諸行省。1328年5月 他迫使老皇帝退位，成為唯一的統治者。他任用約翰六世坎塔庫澤努斯改革司法制度，重建海軍。在他統治期間，東正教隱修院的權勢在宗教和政治方面都日益強大。1334年8月 他承認塞爾維亞對馬其頓的宗主權，並將安納托利亞割讓給奧斯曼土耳其人。不過，他從熱那亞人手中收復了希俄斯、福西亞和萊斯沃斯島諸島，並且恢復了帝國對企圖分裂出去的兩個希臘城邦伊庇魯斯和帖撒利亞的控制。
祖孫相爭
老皇帝安德洛尼卡二世和他的兒子麥可九世、長孫小安德洛尼卡 3 人“共治”國政。這個小皇帝聰明英俊、風流倜儻，雖然小小年紀就享有帝王的特權，但他只是名義上的共治帝，並沒參與國家大事。由於受到祖父的寵愛，他恃寵自驕，生活放蕩，整天沉溺於追逐情婦、狩獵和賭博，往往入不敷出，債台高築。
祖父和父親不得不對他進行管束，對他到處舉債的行為也非常惱火。小安德洛尼卡因此便想擺脫控制，自由自在地生活。他與好友們共同策劃，企圖從祖父手中討得一塊封地，獨占一方。 老皇帝明白他用意何在，拒絕了他的要求，這使得小安德洛尼卡與祖父的關係變得緊張，僵持了很久時間。
最後使得小安德洛尼卡失寵於祖父是由於他的主使，錯殺了自己的親弟弟所引起的。1320 年，小安德洛尼卡發現自己的情人另有所愛，極為惱火，便雇了幾個殺手，要他們查清對方是誰，相機行事。不料那幾個莽撞的殺手竟不管青紅皂白，殺了再說。後來搞清楚，被殺的不是別人，正是小安德洛尼卡的弟弟。
當時，他的父親麥可九世還在薩洛尼卡養病。本已病入膏盲、衰弱不堪，聽到這個悲痛的訊息，頓時急火攻心，一蹬腿，斷了氣。
老皇帝聞訊大怒，下令剝奪小安德洛尼卡的繼承權，取消他“共治”皇帝身份。另立麥可九世的弟弟君士坦丁為自己的直接繼承人。
小安德洛尼卡豈能甘心已將到手的權力又落入他人之手？於是他開始糾集黨羽，與自己的祖父對抗。他的好朋友、大貴族坎塔庫澤努斯和希爾基亞內以重金購買了色雷斯的統治權——在拜占廷帝國晚期，這種花錢賣官做的現象是司空見慣的。於是，他們以色雷斯為根據地，招兵買馬、積蓄力量，準備與老皇帝背水一戰。老安德洛尼卡得知訊息，立即安排了對小安德洛尼卡的公開審判——判他終身監禁。
但是，審判還沒有結束，小皇帝的黨徒即向老皇帝進行恐嚇，迫使他赦免小安德洛尼卡無罪。但小安德洛尼卡又得寸進尺，要求同時赦免他的同黨，被老皇帝拒絕。於是，他決心與祖父抗爭到底，於 1321 年復活節離開首都，投奔他的朋友坎塔庫澤努斯等人，在色雷斯稱帝。於是，便爆發了一場持續7 年之久的戰爭。
小安德洛尼卡知道自己軍力薄弱，不足以與老皇帝的軍隊抗衡，便在色雷斯地區向地主和自由民慷慨許願，大量贈送國有土地，改革稅收政策，從而贏得人民的好感，樂於為他效命。
這樣，小安德洛尼卡迅速地集結起一支大軍，由希爾基亞內統帥，浩浩蕩蕩地向首都進發。 老皇帝聞訊十分恐慌，立刻派人與小安德洛尼卡講和。條件是，承認小安德洛尼卡皇帝的名分，與他分享帝國的統治權，色雷斯和馬其頓地區劃歸小皇帝。自己保有君士坦丁堡和其他地區。並保留外交上的權力。
小安德洛尼卡接受了和平建議。這一來，也就意味著拜占廷帝同已經一分為二了。但這樣的和平局面並沒有維持很久。1322 年，小皇帝的兩個同黨坎塔庫澤努斯與希爾基亞內之間發生了利益衝突，小皇帝支持了前者，希爾基亞內一怒之下便投奔了老皇帝的門下，老皇帝認為時機已到，便發兵進攻小皇帝的轄區。然而卻出師不利，打了個敗仗。 當小安德洛尼卡的軍隊途經薩洛尼卡時，城內軍民甚至把他那位頂替他位置的叔父君士坦丁捆綁起來，交給小皇帝以表忠心。隨後，小皇帝的軍隊又擊潰了老皇帝派來的一支土耳其僱傭軍，兵臨君士坦丁堡城下。
老安德洛尼卡不得不認輸，再次讓步，親自為他的孫子主持了加冕禮，承認小安德洛尼卡為同享治理國家大權的“共治帝”。不久之後，又安排了小皇帝的婚禮，祖孫倆似乎和好如初然而，當小安德洛尼卡帶著他新婚的妻子回到色雷斯領地後，又得到君士坦丁堡傳來的訊息：老皇帝在近臣的挑動下，又有反悔之意，想再次發難。
起先，小皇帝還不相信，要求祖父允許他回首都看看，以證實訊息是否可靠。但老皇帝卻不答應。這就證明訊息並非誤傳。於是，他又向祖父發起第 3 次進攻。結果把他的祖父打得一敗塗地，占領了君士坦丁堡。 公元 1328 年 5 月 24 日，老皇帝被他的孫子廢黜。小安德洛尼卡成為拜占廷帝國唯一的統治者。
一開始，小皇帝還顯得有些不忘骨肉親情，允許他的祖父閒居宮中。兩年以後，在他的同黨影響下，迫使老皇帝住到修道院裡去。從此，老安德洛尼卡便成為安東尼修士，孤寂地度過餘生。 公元 1332 年 2 月，老修士安東尼死於修道院。
