學院成立於1985年，2013年經中央編辦批准，更名為國家食品藥品監督管理總局高級研修學院。主要承擔國家食品藥品監督管理總局教育培訓規劃和年度培訓計畫的組織實施工作；負責食品藥品監管系統教學體系建設（包括學科、課程和教材體系、師資隊伍體系），指導地方教育培訓業務工作；開展食品藥品監管政策理論及教育科學研究；合作開展研究生學歷學位教育；開展教育培訓國際交流與合作；圍繞食品藥品監管中心工作開展行政相對人培訓。
學院秉承“強化責任、提升能力、開拓視野、促進創新”的教育培訓理念，堅持改革創新，不斷探索和把握人才培養規律，充分發揮了食品藥品監管系統幹部教育培訓的主渠道和主陣地作用。建立了以食品、藥品、醫療器械、化妝品安全監管、應急管理和行政管理六大學科為主要內容的獨具特色的學科體系，課程設定覆蓋食品藥品安全監管全部業務領域，打造了以“優秀師資隊伍、精品培訓課程、實用培訓內容、創新培訓形式”為特徵的一系列精品培訓項目，形成了相對穩定的培訓班次。學院還面向社會，開展食品藥品監管法律法規培訓和繼續教育工作，同北京大學、南京大學等國內著名高校合作開展學歷、學位教育。近年來，學院平均每年舉辦各類培訓班200餘期，年培訓人數2萬人次以上。2011年，學院被人力資源和社會保障部評為首批國家級專業技術人員繼續教育基地；2013年，被批准成立博士後科研工作站。
學院恪守“善學、求實、鼎新”的價值觀，按照“研學惟實，修德至臻”的院訓，不斷加強人才隊伍和教師隊伍建設，完善各項規章制度，提升學院教學水平和綜合管理水平。學院堅持教學、科研並重的辦學理念，加強食品藥品監管重大政策和教育培訓理論研究。注重人才的引進與培養，專職師資隊伍不斷壯大。吸納系統內外知名專家、學者兼職教學。目前，已經形成了一支由300餘人組成的素質優良、結構合理，適應新時期食品藥品監管形勢的專兼結合的核心師資隊伍。統籌規劃，大力推進教材體系建設，已基本建立與教育培訓相適應，涵蓋面廣、門類齊全、標準規範、特色鮮明的權威性教材體系。
