後因“九五”期我省公路建設蓬勃發展，於1997年10月增編20人，總計編制40人。2003年4月，為適應我省公路、水運基本建設發展的需要，經省編委批准將原公路工程質量監督站更名為“四川省交通廳公路水運質量監督站”，原有級別、編制和經費渠道不變，站內設：公路工程監督科、水運工程監督科、工程監理科、試驗檢測科和綜合辦公室五個科室。2004年11月，按照省、廳部署，推行事業單位人事制度改革，實行人員聘用制，中層幹部競爭上崗，一般幹部按崗聘用。根據質監站工作性質和管理工作的需要，經廳批覆，原內設機構在不增設內設機構的前提下，調整為綜合辦公室、工程質量監督科、工程安全監督科、資質管理培訓科、工程技術科。站現有正式職工32人，教授級高工3人，高工8人，工程師7人，行管人員（包括駕駛員）9人，外聘人員5人。
