歷史
1902年4月20日：設“嘉義驛”。
1912年：銜接阿里山森林鐵路。
1933年6月：車站本體改建。
1942年：嘉義-民雄間雙線完工，兩站相距9.3公里，中間無號誌站。在台中線新三義隧道完成以及嘉北車站啟用之前，為西幹線站間距離最遠之兩站。
1988年：林宗正牧師、黃昭凱等率領數名原住民青年以電鋸與鋼索拆毀站前的吳鳳銅像，使“吳鳳神話”開始破滅。
1995年：嘉義機務段設立南部通勤電車保養基地。
2007年1月5日：配合高鐵通車，嘉義公車捷運開始行駛。
車站構造
鐵路
台鐵車站（非管制區）：分為前站及後站；前站直接與月台區相通，後站則需經由站內地下道或站外天橋才能到月台區乘車，目前正在改建高架車站。
阿里山森林鐵路車站：使用台鐵第一月台北端東側上下車，並無獨立設定之車站。
嘉義BRT車站：位於後站(嘉義市先期交通轉運中心)。
公車捷運
位於嘉義市先期交通轉運中心後棟。
月台配置
| 阿里山 | 林鐵 | 阿里山線（上山） | 往 阿里山 方向 |
| 1 | 1 | 西部幹線（下行） | 往 台南、高雄、屏東 方向 |
| 南迴線（直通下行） | 往 台東 方向 | ||
| 2 | 無月台 | ||
| 3 | 2A | 西部幹線（上行） | 往 彰化、台中、台北、基隆 方向 |
| 東部幹線（跨線下行） | 往 宜蘭、蘇澳、花蓮 方向 | ||
| 西部幹線（下行待避） | 往 台南、高雄 方向 | ||
| 4 | 2B | 西部幹線（上行待避） | 往 彰化、台中、新竹、台北、基隆方向 |
| 西部幹線（上行始發） | 往 彰化、台中、新竹、台北、基隆方向 | ||
| 西部幹線（下行始發） |
嘉義車站