1924年秋,考入河南焦作礦業大學。1925年6月15日,吳會治被推選為“焦作各界援助滬案後援會”會長。1926年2月加入中國共產黨,隨即被選送黃埔軍校第四期工兵科學習,10月畢業,以排長職編入新編二十一師參加北伐,轉戰江西等地。1927年返回家鄉。
1928年,吳會治在縣立初級中學任教,旋任井溪鄉團練隊長。不久,在王維舟、李家俊的影響下,參加固軍壩起義的準備工作。1929年5月12日牡羊起義後,吳會治擔任起義軍第一支隊長。在二打牡羊、三打牡羊和五爪壞等戰鬥中起了較大作用,打擊吳建臣團進駐井溪壩的戰鬥中,英勇果斷,身先士卒,將吳建臣團擊潰。
1930年7月,起義失敗。吳會治被楊森叛軍旅長侯世炯裹脅,當了侯的參謀長,不久,進入江西星子訓練團受訓。1934年12月底,吳會治被編入駐川參謀團政訓處。1936年12月,改行經商。1950年任萬源縣人民政府建設科長,隨即到川北行署縣政人員學習班學習。學習結束返回萬源,不久病逝。