歷史沿革
1958年，南昌市農業科學研究所建所，以研究蔬菜為主。1968年撤銷，1973年恢復。
1972年，南昌市郊區蔬菜科學研究所建所。1975年8月，研究所改名為南昌市蔬菜科學研究所，隸屬市郊區政府領導。1979年10月，劃歸南昌市蔬菜產銷辦公室領導。
1972年，南昌市水產科學研究所創建，隸屬於原南昌市水產局。
2008年，經市編辦同意、省編辦批准，於2009年由原南昌市農業局下屬的南昌市農業科學研究所、水產科學研究所、蔬菜科學研究所合併組建成立南昌市農業科學院 。
科研條件
人員編制
截至2015年5月，農科院共有職工202人，其中在職職工114人，離退休職工88人；在職專業技術人員61人，其中正高5人，副高24人，中級22人，初級10人；專業技術人員中博士研究生3人（含在讀1人），碩士研究生12人，本科學歷45人；有6人當選為南昌市“521”學術技術帶頭人 。
科研平台
截至2015年5月，農科院設有糧油作物所、畜牧水產所、經濟作物所3個研究所 。
科研成就
科研成果
三亞基地截至2014年底，農科院承擔和完成了國家、省（部）、市（廳）級各類科研項目220餘項，獲得各類獎項32項，其中江西省科技進步二等獎5項、三等獎7項，南昌市科技進步一等獎1項、二等獎10項、三等獎3項；全國農牧漁業豐收二等獎1項、三等獎1項，江西省農牧漁技術改進獎一等獎1項，江西省農科教突出貢獻獎三等獎2項；特別是我院自主研發的“早熟高產辣椒早雜二號”被國家科委確認為國家重大科技成果 。
科技推廣
據2015年5月農科院官網公開資料顯示，農科院近五年送科技下鄉1200餘人次，培訓農業技術人員1000餘人次，培訓農民近20000餘人次，新品種、新技術推廣運用面積3000萬畝。
農科院開展 “十百千”惠農幫扶工程（主動聯繫10個特色農業鄉鎮、100家農業龍頭企業、1000戶特色種養加工大戶進行科技幫扶）以來，與6個特色農業鄉鎮、50多家農業龍頭企業、500多戶特色種養加工大戶建立科技服務合作關係，並建立推廣示範基地30餘個 。
現任領導
院長、院黨委副書記：程春明
副院長、黨委委員：鄒新建
副院長、黨委委員：萬承永
副院長、黨委委員：徐寶慶
