南方科技大學創新創業學院於 2016 年 8 月正式設立，為了突出“創知、創新、創業” 的辦學特色， 南科大結合當前科技創新的新趨勢和對人才培養的新要求，服務深圳國際科技、產業創新中心建設和國家發展。學院致力於聚焦工業研究，培養創新創業高端人才，孵化高技術企業。
創新創業學院以高標準、國際化為參考目標，現已建立一支以40名研究教授為核心、40多名其他院系和國際名校研究教授為支撐、百餘名兼職產業界教授為支持的高水平師資隊伍，實現高水平創新和優質教育。現有23名專職研究教授，其中原工程研究院及高校-院所長、高級研究員4人，原大型企業高級科學家、技術總監5人，海歸創業公司董事長7人。機械、材料、數學、生醫工、電子、計算機、環境等院系積極參與產學研轉化的教授40餘人，其中院士2人。現已聘請60位來自行業內大型企業、高新技術企業、工程類研究院所的高管和專家擔任產業教授、業界導師，計畫達到100人以上。
學院圍繞產學研，現已建成1個先進功能性電子材料聯合實驗室；6個實踐基地，深圳市銀寶山新科技股份有限公司、深圳市華大基因學院，深圳光啟高等理工研究院，深圳市博恩實業有限公司，深圳市蘑菇財富技術有限公司，北京協同創新研究院；正在籌建航空航天技術、重大科學儀器、智慧型製造、大數據、先進材料、生物醫學工程中心實驗平台。學院參照IDEALLAB，設立創業平台，為一流項目和一流人才配備一流的資金籌措和管理團隊，實現技術天才價值最大化。通過跨學科合作實現原始發明的效益最大化，強化並加速實施進度。
創新創業學院志在為國家培養具有優秀的創新思維、較高理論水平和突出的解決實際問題能力的創新創業高端人才。學院規劃開設《工程設計與實訓》、《設計文化》、《整合創新設計》等10餘門創新創業課程，現已聯合電子、材料、環境三個系牽頭成功申請了工程碩士專業學位點。學院聯合機械系、人文中心共建的《創新設計與工程實踐》課程已入選廣東省創新創業教育課程。兩年來，學院已招收了194名工程碩士,已建立較為完備的、獨具特色的研究生培養方案和課程體系。
