南方國家級林木種苗示範基地（簡稱南方種苗基地）於1999年由原國家計委批准立項，中國林科院負責籌建，2003年完成基本建設，2004年9月正式與桉樹中心合併，實行“兩塊牌子、一套人馬”的管理模式。
基地設計生產規模為年產優質苗木5860萬株（枝），組培苗1000萬株,優良種子7030kg。主要品種包括纖維原料林樹種、珍優闊葉林樹種及經濟林樹種、觀賞綠化樹種及花卉和防護林樹種等，其建設規模和生產能力為目前國內之最。
南方國家級林木種苗示範基地採用高標準、高科技、高效益的模式，依託中國林科院多學科的科技人才及其科研成果優勢，採用國外先進技術、設備、生產工藝和管理手段，集科研、推廣、培訓、生產經營、科普、旅遊觀光為一體。基地具有林木良種選、引、育、繁整體功能，是我國工業原料林基地建設、生態環境建設、城市綠化美化建設的重點基礎工程和示範工程；是我國林業一流的林木良種研究和繁育基地、林木種苗理論與技術科研基地、一流的現代化林木種苗生產和技術示範基地、一流的林木種苗人才和技術培訓基地、一流的南方林木種質資源保存基地；是我國林業科技創新和高新技術產業化基地；林業國際合作和對外交流的基地；是我國建設現代林業的標誌性工程。
未來發展
年輕的桉樹中心（南方種苗基地）煥發出勃勃生機。以支撐現代林業發展為中心，以提高自主創新能力為主線，以推進管理體制創新為動力，以創新體系建設和產業建設為重點，以條件建設和隊伍建設為基礎，通過“支撐現代林業，實施重大項目，構建創新體系，提升創新能力，推進成果轉化，創建和諧院所”六大舉措，緊緊圍繞科學研究、科技開發、科技產業及條件保障，謀求全面穩定的發展。
從提升創新能力入手，大力增強科技成果的供給能力和轉化能力，以創新促進和引領林業產業發展。特別是在桉樹商品人工林林培育技術及市場化運作模式上和林業科技推廣與技術服務體系中爭取更大成就。發揮其在我國林業科技創新體系的“區域科技中心”和“林業科學試驗基地”的作用，為我國林業生態建設和產業建設作出應有的貢獻。
