馬克思主義學院的前身是1958年成立的政治理論教研室、1978年成立的馬列主義教研室、1987 年成立的南京郵電學院社會科學部,2004年更名為社會科學系,同年開始招收公共事業管理專業本科生, 2008年9月更名為人文與社會科學學院,2011年3月與人文與社會科學學院分立,成立馬克思主義學院。
馬克思主義學院現設原理教研室、德法教研室、概論教研室、綱要教研室四個教研機構。另設學院辦公室、圖書資料室、教學檔案室三個管理與教輔部門。此外,物聯網產業發展研究基地掛靠我院。
馬克思主義學院承擔學校本科生、研究生思想政治理論課教學工作和馬克思主義理論科學研究、學科建設工作。近年來,在學校黨委的高度重視和領導下,學院不斷加大教學改革創新和課程建設力度,構建四位一體的教學機制,切實提高思想政治理論課的教學質量和水平,充分發揮在學校思想政治教育中的主渠道作用。