2003年5月19 日被國家勞動和社會保障部批准晉升“南 京市交通高級技工學校”，同年6月2日省政府授權江蘇省勞動和社會保障廳批准增掛 “南京交通技師學院”校牌；2004年4月被教育部等六部門列為“汽車運用與維修專業緊缺型高技能人才培養培訓基地”，2006年被教育部授予“國家級職業教育（汽車運用與維修專業）實訓基地”，獲“江蘇省職業教育先進集體”、“江蘇省第二批高技能人才培養示範基地”榮譽、資質，具有南京市高技能人才培訓基地、南京市專業技術人員繼續教育基地、南京市勞動預備制培訓基地、省級技能鑑定所等資質，並與重慶交通學院、金陵科技學院等聯合辦學，進行大專、本科學歷教育。
學校以“按照科學發展觀的要求，堅持強教興產，以教為本，以產促教，促進學院全面、協調和可持續發展”為辦學宗旨，以“立足交通，奉獻社會，嚴謹務實，求真創新，培養全面發展的高技能人才”為質量方針，以“由量的擴張向質的提高轉變，由粗放外延型發展向集約內涵型發展轉變”為發展模式，擁有在校生5千餘人，開設了國中起點和高中起點的汽車維修檢測、現代物流、數控技術、公路施工與監理等20餘個專業，高級工和技師的培養比例占70%以上；建有汽車維修技術、汽車駕駛技術、起重機械運行與維修、數控技術、運輸商務實訓基地；畢業生就業率達99%以上，近三年連續獲得“江蘇省招生就業工作先進單位”稱號。
學校實行院系兩級管理，設有汽車套用系、船舶技術系、交通工程系、運輸商務系、智慧型信息系、機械工程系、基礎部、培訓中心等6系1部1中心和11個職能處室。現有教職員工600餘人，其中專職教師199人。專職教師中，本科以上學歷160餘人，具有高級講師、高級實習指導教師、技師及以上專業技術職務或資格的教師為71人，“雙師型教師”49人。擁有各類現代化教學設施設備價值約4000萬元。
學校附屬的南京交通獅麟駕駛學院為江蘇省一類文明示範駕校，擁有華東地區一流的獅子壩全封閉駕駛訓練基地，堅持“我們的服務與您的需求同步”的服務承諾，實行“網上模擬理論考試系統”、“預約計時培訓”，不斷改進創新教學模式，提高培訓質量，年均路考、樁考合格率名列全市駕校首位，年培訓量達1.6萬人，獲省級“巾幗示範崗”、“青年文明號”，市級“青年文明號”等多項文明示範榮譽稱號。
