北京聯合大學功能食品科學技術研究院（以下簡稱：研究院）是於2010年5月在我校“生物活性物質與功能食品實驗室北京市重點實驗室”和衛生部認證授權的保健食品功能檢測機構—“保健食品功能檢測中心”的基礎上成立的，為北京聯合大學校級科研機構
該學科通過近十年的建設和發展，到1992年被原北京市高教局批准為重點建設學科（A類）。學科特色為研究食品（活性物質）與人類健康的關係，從事生物活性物質製備及生理功能研究、功能食品的功能評價及方法研究、生物活性物質的毒理學研究、食品加工過程對生物活性物質以及營養素活性的影響研究、影響食品安全的環境因素研究、功能食品發展戰略研究。目前在保健食品功能檢測及其方法學研究、紅曲中的活性物質製備及其分析、老年痴呆（AD）的基礎研究及抗老年痴呆（AD）活性物質篩選、番茄紅素製備技術等方面，具備了相對優勢。研究院現有實驗室4000餘平方米，擁有許多大型、先進的儀器設備 ，總計價值近四千萬元（50萬元以上大型儀器設備18台）。擁有衛生部認定的保健食品功能檢測機構，獨立的SPF級實驗動物房。當前，研究院在我國保健食品的研究領域中處於領先地位 ，現正在籌備申請國家教育部重點實驗室。
研究方向：
北京聯合大學功能食品科學技術研究院一直從事功能因子套用基礎研究，經多年的堅持與發展逐步凝鍊出相互關聯、系統性較強的四個研究方向：生物活性物質製備及生理功能研究；功能食品的功能評價方法研究；用於功能食品的生物活性物質的毒理學研究；功能食品發展戰略研究。
學術隊伍：
研究院目前擁有專職研究人員18人，其中高級職稱8人，中級職稱8人；具有博士學位研究人員4人，碩士學位研究人員6人。
研究成果：
近3年主持國家科技支撐計畫重點項目1項，國家自然科學基金項目4項，北京市自然科學基金項目3項，省部級等項目近20項。科研經費1100餘萬元。發表論文總計52篇，其中以通訊單位或第一完成單位發表CSCD收錄論文26篇；SCI、EI收錄論文15篇（IF4.0以上2篇）。授權發明專利3項，申請專利3項。獲得省科技進步三等獎1項。參與制定國家行業標準1項。
