醫學圖書館館舍面積為10200平方米,提供閱覽座位600餘個。藏書以生物及醫藥衛生類為主,截止到2007年,共有各類藏書54萬餘冊。圖書館收藏有中外文紙本期刊近4000種,其中中外文現刊1000餘種。目前我館有電子期刊10000餘種,其中生物醫學類電子期刊5000餘種。為方便讀者,除特藏書外,各閱覽室和書庫均實行全方位的開架服務。除書本式藏書外,圖書館還收藏有其它多種類型載體的文獻資料,如磁帶、錄像帶、縮微平片、多媒體光碟等。近年來不斷引進多種光碟資料庫及網上資料庫供讀者檢索使用。
醫學圖書館文獻資源與北京大學各附屬醫院圖書館文獻資源協調配套,共同形成全校醫、教、研工作所需的醫藥衛生文獻保障系統。圖書館特藏有珍、善本古代圖書,其中有中國大陸唯一珍善本——手抄本《太平聖惠方》一部十函共100卷100冊。
圖書館現設有館長室、辦公室、採訪編目部、自動化部、圖書流通部、期刊流通部及信息諮詢部。
自1993年起,圖書館各項工作全面實行計算機自動化管理。
1985年,國家教育部在醫學部建立了全國唯一的醫學外國教材中心。該中心設在圖書館。中心積極引進國外優秀醫學教材和教學參考書,為全國醫學教材的研究與發展提供文獻信息保障。
1991年被衛生部確定為文獻資源共享網路系統華北地區中心館。
1993年被衛生部醫學情報工作管理委員會確認為科研成果查新定點單位(北京大學醫學信息諮詢中心)。
1998年教育部決定在北京大學醫學部設立中國高等教育文獻保障系統(CALIS)全國醫學文獻信息中心,作為“211工程”醫藥重點學科所需文獻的保障基地。該中心也設在本館。
本館提供的主要服務內容有:館內閱覽、圖書外借、信息諮詢、科研立項及成果鑑定查新、定題服務、計算機光碟與網路資料庫檢索、計算機操作與Internet瀏覽、聽音、多媒體光碟閱覽、館際互借、文獻傳遞、文獻縮微與幻燈片製作、文獻複印等。
本館同時承擔各專業本科生、研究生和部分進修生的醫學文獻檢索與利用教學,並不定期地舉辦各類計算機檢索培訓班。圖書館還將根據讀者的要求不斷擴大業務範圍,改進服務手段,提高服務質量。
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