學科的優勢以及教學的軟、硬環境，是一個專業吸引力所在。作為新中國成立後第一個建立起來的培養文物考古專門人才的高等教育機構，北京大學考古文博學院在悠久的歷史發展中，經由幾代考古人的不懈追求與努力，擁有了相對完善的學科體系、優秀的教學力量、豐富的教學資源。
學科的建設，最能體現一個專業的傳統和創新。結合傳統與考古學的發展趨勢，現學院設立考古學、博物館學、文物保護、古代建築四個本科生專業及方向。其中文物保護專業方向和古代建築專業方向為1998年與國家文物局聯合辦學後，根據國家需要分別於1998年、1999年開始招生。
考古學專業為國家重點學科。現有碩士研究生專業1個，即考古學及博物館學專業，包括舊石器考古與古人類學（含動物考古）、新石器及夏商周考古、漢唐宋元考古、佛教考古、中外文化交流考古、陶瓷考古、田野考古學、博物館學、博物館藏品研究、中國古代建築、科技考古、文物保護科學等12個研究方向。現有博士研究生專業1個，即考古學及博物館學專業，包括舊石器時代考古、中國新石器時代考古、夏商周考古、戰國秦漢考古、隋唐考古、宋元考古、陶瓷考古、宗教考古、中外文化交流考古、科技考古、古代建築、文物保護科學、古代文物研究等13個研究方向。考古專業設有全國人文社會科學第一批博士後流動站（與北京大學歷史系共有）。1個博士點中所能招生的研究方向及博士生導師的數量，在全國高校考古專業中也是僅有的。其中舊石器考古教學與科研在全國高校中位居前列，在舊石器時代遺址發掘及微痕研究方面取得的成果屬國內一流。新石器考古、商周考古、漢唐考古、佛教考古，是學院考古教學和科研的特色之所在。目前，國內外高校的許多教師，都曾在學院進修過上述相關方向的課程。這從另一方面說明學院在上述教學和研究領域中的優勢。目前上述方向在師資力量及學術水平方面仍屬國內一流，學術隊伍的梯次配備，也較合理。
博物館學專業是1988年組建的，1998年設立博物館學方向碩士點，依託考古專業紮實的教學和科研基礎及其雄厚的師資力量，現其課程已經比較完善。
在教學方面，北大考古文博學院目前有著不同層次的教學體系，且已經實現了教學的多層次化和國際化。
首先是對考古專業人才的培養。北大考古文博學院每年向海內外招收本科生30~40人，碩士研究生15~20人，博士研究生8~10人左右，博士後工作人員1名，外國留學生、進修生10人左右。另每年接收進修生、進修教師3~5人，訪問學者3~5人。現共有不同層次的在校學生200餘人。
隨著教學規模的擴大，科學研究的不斷深入，一批批不同專業方向的學員陸續走向文物考古第一線，這將不斷地改善文博隊伍的構成狀況，提高整個行業的業務水平，產生良好的社會效益，為我國文物事業的可持續性發展做出積極的貢獻。截至目前為止，考古學系已接納了前蘇聯、越、日、韓、美、英、德、法、意、挪威、瑞典、丹麥、比利時、加拿大、澳大利亞、紐西蘭、印度、墨西哥、斯里蘭卡等25個國家和地區的留學生、進修生、本科生、研究生，將中國考古學推向世界。
其次，在發展計畫內國民高等教育的同時，根據國家文物局的需求和我國文博系統從業幹部提高專業素質的需要，北大考古文博學院利用暑期集中授課，先後在北京和重慶、成都舉辦了三個考古學及博物館學研究生課程進修班，並在四川舉辦了面向全國有關單位的佛教考古方向的專門化研究生課程進修班。近年來，受國家文物局及有關省、市文物部門的委託，先後舉辦了“全國文物處處長培訓班”、“全國省級博物館館長培訓班”、“全國省級博物館業務骨幹培訓班”、“田野考古技術培訓班”（2003年）及多個不同類型的碩士研究生主要課程班。經國家教委批准，學院舉辦過“21紀考古學理論與實踐高級研討班”等兩個研討班，在做好繼續教育工作方面積累了一定的經驗。在舉辦在職幹部培訓班時，充分發揮了在京辦學的優勢，先後聘請了在京文博單位的專家、領導，及北京大學的著名學者擔任教學工作，採用理論聯繫實際的教學方法，取得了較好的教學效果，受到學員的好評及業務主管部門的肯定。尤其是“全國省級文物局（處）長專業培訓班”（2003年）、“省級考古研究所所長專業管理培訓班”（2004年）時間較長，其教學安排除了在校上課外，還外出考察實習，撰寫考察報告並舉行答辯會，學員們普遍反映收穫較大。受國家文物局委託，目前全國田野考古領隊培訓班的教學工作也由考古文博學院承擔。
