基本玩法
艦隊收藏玩家可進行的指令，分為出擊、編成、補給、改裝、入渠及工廠6種。在遊戲開始時可得到1位艦娘及一些資源，增加艦娘數目的方式，除了建造（“工廠”內其中一個指令）外，也可以在打倒敵人後拾得掉落的艦娘。而艦娘的育成，則為在出擊後借著等級上升來強化，並用以編制強大的艦隊。艦娘的建造與修理，必須使用的物資為燃料、彈藥、鋼材及鋁土礦這4種參數。這些物資會隨時間經過自動增加。玩家亦可以通過遠征（“出擊”內其中一個指令）來增加所擁有的物資。
玩家被指派進行任務（探索）後，在滿足完成任務的條件時會獲得燃料及彈藥作為獎賞，亦有可能取得強力的艦娘，或者增加1個能擁有的艦隊等特典。
艦娘本身均設有耐久度，輕微損毀時會在其圖示上噴出黑煙，而在中度損毀或以上的狀態其插畫會出現變化。耐久度降至0時即被判定為“擊沉”，在對殘存的艦隊留下遺言後該艦娘將會消失（損失）。沒有任何方法可令被擊沉的艦娘復活，只可以重新訓練同種艦隻作為替代。但裝備有應急修理要員的艦娘被擊沉時可以回復至大破狀態，但會消耗一個應急修理要員，另外氪金道具應急修理女神可以使艦娘直接回復至滿狀態。
敵方艦隊被稱為“深海棲艦（しんかいせいかん）”，是以軍艦與輸送艦等所構成但實質不明的一群怪物。雖然多數怪物的形狀與生物不甚相似，但是戰艦與航空母艦等強力的敵人則為女性的形態。在期間限定的特別活動及部分高難度的場景中登場的“深海棲艦”，會被被賦與“鬼”“姫”“浮游要塞”等與一般艦種有別的特殊名稱，而其登場的場景亦與通常的敵人有所不同。
遊戲每季度還會推出限定活動，限定活動一般持續2周時間，期間會獨立開放新的海域和地圖，難度較大，通關會給予豐厚的獎勵，也是新艦娘、新裝備、新敵艦集中實裝的時期。
程式
編成
艦隊收藏補給
當艦隊完成作戰、演習或遠征後，會消耗資源中的燃料和彈藥（航母還需要補給鋁材），這時就需要對艦隊進行補給。艦娘對資源的需求量按艦種級別會逐步上升，改造後的艦船的需求量也會較改造前上升。如果不能及時為艦隊補給，艦娘出擊後疲勞的機率會大大增加，也會更容易被敵艦擊中受損。所以玩家們在讓艦隊出擊前先關注一下自己的資源還夠不夠用吧。
工廠
遊戲中艦娘和裝備的主要獲取方式之一就是工廠中的建造和開發，當然這也是最耗費玩家資源的地方，建造艦娘所需的資源從30~7000不等，開發裝備的最大資源消耗量也會達到300，而且建造時間也會隨著艦種級別的上升而延長，最高可達到8小時，當然遊戲中提供了可以快速完成的氪金道具。同時工廠中還可以將不需要的艦娘和裝備拆解來換取少量資源。初始建造船塢為兩個，玩家可以通過氪金來增加船塢。
改裝
改裝指令中又分為近代化改修（合成）和改造，同時在這裡還可以更換艦娘的裝備，裝備欄最大為四格。近代化改修類似於卡牌遊戲中的合成，可將最多5隻副艦娘合成進主艦娘中，但合成後不提升艦娘等級，而是提升其能力值（除耐久）。不同艦種的艦娘提升的能力值不同，如驅逐艦可提升雷裝和裝甲，航空母艦提升對空值等等。當艦娘達到一定等級後可以進行改造，艦娘普遍只有一次改造機會，部分艦娘可以改造兩次及以上，改造後艦娘的能力值會大幅上升，這也是為數不多的可以提升艦娘耐久的途徑。
入渠
艦娘在戰鬥中不可避免的會被敵艦擊中受損，這時就需要讓艦娘入渠維修。入渠會消耗資源中的鋼鐵和燃料，同時維修時間會因等級、艦種、受損程度的上升而延長。入渠中也含有與建造相似的快速完成道具和擴充船塢。
出擊
指揮艦隊駛入外海與深海棲艦——遊戲中的主要敵人作戰。分為鎮守府海域、西南諸島海域、北方海域、西方海域、南方海域和中部海域，越往後難度越高。每個海域中有四個基本作戰地圖（部分海域有額外地圖），這些作戰名稱基本改編自太平洋戰爭中的史實戰役。每幅地圖中可能存在多條路線，這些路線通常是隨機選擇的，部分路線有限定的艦隊編制才能通過。路線中包含若干個路徑點，紅色代表戰鬥，綠色代表資源，藍色代表安全，紫色代表漩渦（會扣除少量資源）。玩家必須將圖中Boss擊破才能解鎖下一地圖，後期地圖中Boss需要反覆多次才能擊破。路線中每次戰鬥過後可以根據情況選擇撤退以保證艦隊安全，返航後消耗燃料和彈藥，需要進行補給；如果艦娘受損則需要入渠維修。
演習
讓艦隊與其他玩家艦隊進行對抗，即PVP模式。演習模式每天會定時刷新兩次，每次提供5位玩家，只能與每位玩家演習一次。所提供玩家只與自己的戰果排名匹配，等級不一定相近。演習中獲得的經驗往往高於出擊，所以一定要積極參加演習。戰鬥過程與出擊模式相似，只是演習中，雙方艦船都不會被擊沉，演習結束後艦娘所受到的一切損害均消失，但仍然消耗燃料和彈藥。
遠征
命令艦隊遠征探索資源，是遊戲中除了自然回復以外最佳的資源獲得方式。和出擊模式相似，遠征模式中也將任務劃分在6個海域內，越往後遠征難度越大，但獲得的資源也越多。遠征模式只能使用第2、3、4艦隊參加，遠征中不會觸發戰鬥，但想要使遠征成功要有正確的艦隊編制，否則失敗率為100%。遠征模式中除了可以獲得資源，還可以作為支援艦隊協助主力艦隊在出擊模式中的作戰，但只限於目前難度最高的南方海域和一些限定活動海域中，玩家們也可以合理運用支援艦隊來使自己獲得更高的勝率。
資源
艦隊收藏此外還有用以建造和開發用的開發資材，能夠快速修復受損艦娘的高速修復材料，以及可以加快建造的高速建造材料，這些材料也可以通過任務和遠征獲得。
陣型
艦隊在不同戰鬥中會變換不同的陣形來發揮艦隊優勢，《艦Colle》中提供了5中陣形：
單縱陣：基礎陣形，艦隊艦船3艘以內時強制選擇，攻擊特化陣型，大幅提升炮擊和雷裝傷害，對潛能力低。
復縱陣：艦船4艘及以上可選，攻守平衡陣型。炮擊戰命中率高。
輪形陣：航空戰以及反潛戰有利陣型，提升己方航母傷害並降低對方航空攻擊傷害，但是會大幅削弱炮戰和夜戰傷害。艦船5艘及以上可選。
梯形陣：提升雷裝與夜戰迴避率的陣型，4艘及以上可選。
單橫陣：提升反潛能力和迴避能力的陣型，炮擊和雷裝傷害大幅降低，雷裝命中率大幅下降。艦船4艘及以上可選。
艦船類型
本作中艦船全部選自史實艦船，艦種分為驅逐艦（DD）、輕巡洋艦（CL）、重雷裝巡洋艦（CLT）、重巡洋艦（CA）、航空巡洋艦（CAV）、戰列艦（BB）、航空戰艦（BBV）、水上飛機母艦（AV）、輕空母（CVL）、正規空母（CV）、潛艇（SS）、潛水空母、揚陸艦、工作艦、給糧艦、練習巡洋艦、潛水母艦。
裝備
艦隊收藏火炮
分為主炮、副炮、高角炮等，為水面艦艇（除航母）的主力裝備，口徑大小與艦艇等級對應，即小口徑火炮對應小型艦艇（如驅逐艦），大口徑火炮對應大型艦艇（如戰艦）。火炮集中增加艦娘的火力值，部分火炮還可以略微增加對空值。
魚雷
適用於驅逐艦、巡洋艦和潛艇的武器裝備，集中增加艦娘的雷裝值。魚雷和火炮的武器組合可以艦娘在夜戰中獲得連擊或暴擊的效果。其中，特殊潛航艇甲標的擁有使裝備艦娘參加開場雷擊戰的特殊效果，且普遍會對敵艦造成重創，入手相對比較容易，是提督們的必備利器。
艦載機
分為水上飛機和航空艦載機。水上飛機可裝備在普通中大型艦艇上，普遍用於反潛或偵察，航空戰艦和航空巡洋艦裝備水上飛機後也可參加航空戰。航空艦載機只能裝備在航空母艦上，為航空母艦的主要作戰裝備，又詳細分為戰鬥機、轟炸機、攻擊機等，給艦娘增加不同的能力值。夜戰中，艦載機無法起飛參與戰鬥（深海棲艦flagship級空母、輕母可以夜戰）。其中，震電改、天山一二型(友永隊)、彗星(江草隊)屬於五星極稀有裝備。（震電改為13年7月初營運時排名獎勵，現已無法獲得；友永隊及江草隊分別需飛龍、蒼龍二改後獲得）
電探
類似於現代艦艇上的雷達設備，用於提升艦娘的索敵能力和命中率。按電探大小分為大型電探和小型電探，按電探功能又分為對空電探和對水上電探，對空電探還可以提升艦娘的對空值，同時可使艦隊在航行途中避免漩渦的影響。在部分地圖中，必須依靠一定的索敵值才能進入Boss戰，因此電探的裝備也是十分必要的。
反潛
主要裝備於驅逐艦和輕巡洋艦上的用於提升艦娘反潛能力的裝備。由於能夠攻擊潛艇的水面艦艇較少，因此需要對有限的能進行反潛的艦娘進行強化，此時反潛裝備就顯得十分重要了。反潛裝備分為爆雷投射機和聲納，聲納還可以提升艦娘的命中率，但獲得機率更低。
對空機槍
功能比較單一，能提升艦娘的對空值，獲得機率高。想提升艦娘對空值的低等級玩家可以考慮開發使用這類裝備。
特種炮彈
分為九一式撤甲彈、一式撤甲彈和三式彈（對空），只能裝備在中、大型艦艇上（除航母），分別提升艦娘的火力值和對空值，通常與其他裝備組合使用可以體現出效果，三式彈對於陸基型Boss也有著特別的效果。
版本
零售版
於2013年9月26日舉行為出版業而設的發表會“KADOKAWA GAMESTUDIOMEDIABRIEFING2013AUTUMN”中，角川遊戲發表了成立新品牌“KADOKAWA GAMESTUDIO”的訊息，同時間亦正式公開了該品牌正在開發《艦Colle》PlayStationVita版的訊息。Vita版將預定於2015年春發售，而標題暫時被命名為《艦Colle改》。網頁版與零售版版實為在差不多時間同時進行製作，因此PS Vita以作為遊戲平台，其實在正式發表2013年已經決定。另外，在2013年9月9日舉行的“SCEJA會議2013”中，在介紹PS Vita新作的影片內出現了“赤城”的圖像，這已暗示了將會開發Vita版。
街機版
《艦隊Collection》的街機遊戲版《艦Colle Arcade》由世嘉開發，預定於2015年夏開始運營。遊戲的試玩版本於2015年2月13日至14日期間在千葉縣的幕張展覽館舉辦的街機遊戲展會“JAEPO2015”中展出。
爭議
韓國報章《韓國日報》在2013年11月3日撰文批評，指因為近年日本政治右傾化，企圖以《艦隊收藏》這款遊戲去歌頌大日本帝國海軍和戰爭，向日本年輕人灌輸軍國主義。而《日本時報》的評論則反駁，指該遊戲完全沒有任何政治取向，亦和日本政界右翼勢力抬頭無關，評論員舉出類似題材的動漫畫作品《宇宙戰列艦大和號》為例，雖然這作品受到同樣的批判，但它對日本本土的政治影響微乎其微，右翼份子也不會喜歡見到在網上搜尋軍艦圖片時，全部變成可愛的美少女的模樣。
