凌雲閣呈方形狀,歇山頂三重檐木石結構,高約14米,邊長10米,寬6.6米,占地面積103平方米,二樓以上是木結構。凌雲閣是近代彷古建築,但較為完整地體現了晚清時期的建築風格和造型藝術,屋檐斗拱,四角起翹;雕工精細,彩繪逼真。樓閣四周均由雕花木格扇門組成窗欞。城門樓朝北二檐下懸掛著的“凌雲閣”三塊單字匾額和楹聯,是晚清時期雲南名書法家陳榮昌的作品。匾額為行書,楹聯改換楷書體,上聯寫的是“柱石撐天閭閻撲地”,下聯為“雲山府首星斗捫胸”,筆法蒼勁古樸,謹嚴雄肆。樓閣共有3層,底層全用料石砌成,牆厚近1米,十分的堅固,門洞是由條石砌成的拱門。