西漢時,中央政府往吐魯番地區委派“戊己校尉”,設立“交河壁”。北魏至唐初,為高昌王國屬下的交河郡。西州設立後,此城為西州治下交河縣。唐朝派駐西域的最高軍政機構安西部護府,最初曾設於此城。8世紀中葉至9世紀中葉,交河曾為吐蕃人所據,後又為回鶻高昌王國屬下交河州。13世紀末葉,毀於蒙古貴族叛亂之戰火中。
交河故城現存遺址,是其昌盛時期所建之規模,大體為唐代遺存。城門兩個,南為主門,但已毀。東門保存較好,門道及安裝門額的洞依然可見,門內設藏兵之所,以備守戰。
城內建築遺址,約22萬平方米麵積。大體可分為寺院、民居。官署等部分。入南門,有一條長約350米,寬約10米,直通城中心偏北部一座全城最大佛寺的主幹道。佛寺山門前佛塔猶存,凌頂可一覽全城風貌。城內還有佛寺多處,城東南為衙署、官邪區,全城唯一磚瓦的大型建築,即在此區域內。據考證,那座有地上地下雙層建築,氣勢宏偉的宅院,可能即唐時安西都護府所在地。
交河故城建築風格與高昌不盡相同,多為挖地成院,掏洞成室,夯土為牆,屋宇多為兩層,臨街不見門窗,穿巷方見大門。此為典型的唐代建築特色。如今遊人至此,仍可走街串巷,登堂入室,頗具情趣。1961年,交河故城被列為全國重點文物保護單位。