該所主要研究方向有現代分析理論與新儀器的研製、光分析化學、電分析化學、色譜分析、藥物分析、現代分離技術、生物分析化學、環境分析化學和環境污染控制化學等。為適應國民經濟發展的要求,該所充分發揮學科優勢,大力開展科學研究工作。 1996年至2001年先後承擔各類科研項目34項,其中“973”計畫1項、國家基金課題7項、省部委課題18、其它項目9項,取得了一批達到國際或國內先進水平的科研成果,形成了自己的特點和優勢。近年來,獲廣東省自然科學獎3項、廣東高校科技進步獎 2項。
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