二者比較
（一）胃鏡
1.胃鏡檢查優點
胃鏡研製套用雖已有百多年的歷史，但真正廣泛套用於臨床是纖維胃鏡誕生後近30年的事，現已充分顯示出其他檢查難以替代的優越性。胃鏡檢查的優點有：
（1）直觀通過胃鏡可以直接觀察食管、胃、十二指腸球及球後部黏膜。以前如此直觀的效果只有手術中才能見到，在目前不但胃鏡操作者可以看到，還可以通過電視螢幕顯示，供助手和其他醫生共同會診和協同操作。具有放大作用的內鏡還可以將圖像放大，對診斷更加方便有利；
（2）準確通過胃鏡可以直接看到病變是否存在，大小形態，與周邊黏膜的關係，並且可以染色後進一步觀察活檢。這樣在直接和準確檢查的同時又可以活檢的方法，是其他檢查方法所不具備的。
（3）安全胃鏡鏡身較為柔軟，光源為冷光源，無射線輻射，套用很安全。隨術者操作水平的提高，絕對禁忌證明顯減少，許多上消化道急症如嘔血、黑便等均可進行急診胃鏡，保證了及時診斷，提高了治癒率；
（4）診治並行目前胃鏡檢查已不再是單純的診斷，而是診斷與治療能夠同時進行的先進手段。使以往許多需要剖腹探查手術的患者免除了開刀之苦；
（5）資料完整可靠、圖文並茂目前胃鏡檢查同時能將資料直接錄相或拍成照片、幻燈片，可作為診斷的依據，同時還可以列印成檔案，直接放入病例，圖文並茂，便於以後會診和複查。
2.胃鏡檢查缺點
胃鏡檢查需要有一定設備，檢查者要有一定經驗，檢查時要將胃鏡插入患者胃內，患者可能會有恐懼感和輕度噁心不適，使一部分人不願意接受。
（二）X線胃腸透視
1.X線胃腸透視檢查優點
與胃鏡相比，X線胃腸透視檢查的特點是：臨床上套用歷史更悠久，經驗更成熟、更豐富。一般人認為檢查時痛苦稍少，可以從整體上了解病變部位，大小和與整個胃的關係。
2.X線胃腸透視檢查缺點
需要在X線下進行，要接受一定量的放射線照射，病變影像是通過X射線投照到螢光屏上的投影，而非直接觀察病變，因此陽性率不如胃鏡高，且不能活檢，不能同時進行治療。
趨勢
因此近年在上消化道疾病診斷中，胃鏡檢查已呈普及增多的趨勢。
