成立於1956年10月,當時屬中國科學院;1959年9月,劃歸上海社會科學院。 歷史研究所是研究上海歷史的重要中心,主要任務是根據上海地區的特點,開展以中國近現代史為主,以上海史為重點的各項研究,總結歷史經驗,探索發展規律,為社會主義物質文明和精神文明建設服務。現設有古代史室、近代史室、現代史室、上海史室、社會史室、思想文化史室六個研究室。 經四十年的積累和幾代研究 者的不懈努力,在這方面取得了豐碩的成果。1999年則出版了十五卷本、近六百萬字的《上海通史》。 被評為上海市哲學社會科學著作成果一等獎,又獲得國家圖書獎。歷史所還相繼編寫出版了《近代上海大事記》、《現代上海大事記》、《近代上海城市研究》、《東南沿海城市與中國近代化》、《上海道契》、《上海近代經濟史》、《上海地名小志》、《百年上海灘》、《上海舊影》、《百年上海城》等有關上海研究的成果和資料彙編。
全國中文核心期刊《史林》(雙月刊),是上海社會科學院歷史研究所編輯出版的歷史學專業期刊,發表各類學術論文,深受國內外學術界同行的好評。
歷史研究所的目標,一方面是繼續發揮近代史、上海史研究的優勢,另一方面則積極扶持江南史、社會史、思想文化史等方面的研究,不斷擴大與國內、國際學術界的聯繫和交流,為本國和世界的文明建設作出更大的貢獻。
上海社會科學院歷史研究所機構設定:辦公室、資料室、上海史室、古代史室、近代史室、現代史室、思想文化室、社會史室。
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