主要職責
（一）貫徹執行有關水務、海洋管理的法律、法規、規章和方針、政策；研究起草有關水務、海洋管理的地方性法規、規章草案和政策，並組織實施。
（二）根據本市國民經濟和社會發展總體規劃，負責編制本市水務、海洋專業規劃、中長期發展規劃和年度計畫，並組織實施；會同有關部門，制定本市水功能區劃、海洋功能區劃；參與制定流域防洪、水資源和海區海洋經濟、資源、環境等規劃。
（三）負責本市水資源（地表水、地下水）的統一管理和保護；負責制定水資源中長期供求計畫、水量分配和調度方案並監督實施；組織實施取水許可制度、排水許可制度和水資源費徵收工作；核定水域納污能力，提出限制排污總量建議；負責計畫用水工作、節約用水工作。
（四）會同市有關部門，管理灘涂資源，組織編制灘涂開發利用和保護的規劃、年度計畫並監督實施；負責本市長江河道的采砂管理。
（五）主管防汛抗旱工作，承擔市防汛指揮部的日常工作。
（六）主管本市水文工作，組織實施水文水資源監測、水文站網建設和管理，發布水文水資源信息、水文情報預報和水資源公報。
（七）負責水利、供水、排水行業的管理，並承擔相應的監管責任；研究提出有關水務的價格、財務等經濟調節意見，參與對水務、海洋管理資金使用的管理。
（八）主管本市河道、湖泊、江海堤防，負責本市水務工程建設和管理；組織、指導和監督水務工程設施的建設和運行管理；負責本市水務建設工程質量和安全監督管理；負責實施具有控制性的或跨區域的重要水利工程的建設和運行管理。
（九）負責農村水利工作，組織、指導農田水利基本建設；會同市有關部門，組織實施水土保持工作。
（十）負責本市海域海島的監督管理；審核海域使用申請，實施海域權屬管理和海域有償使用制度；負責海底電纜、管道審批和監督管理；負責本市海域勘界、海洋基礎數據管理；負責綜合協調海洋事務。
（十一）承擔保護海洋環境的責任，組織海洋環境調查、監測、監視和評價；會同有關部門，制定地方海洋環境保護與整治規劃、標準、規範，執行國家確定的污染物排海標準和總量控制制度；負責防治海洋工程項目和海洋傾廢對海洋污染損害的環境保護工作；核准海洋工程環境影響報告書，提出海岸工程環境影響報告書的審核意見；監督管理海洋自然保護區，負責海洋生態環境保護；負責海洋環境觀測預報和海洋災害預報警報。
（十二）依法實施水行政執法和海洋行政執法，查處違法行為；協調部門間和區縣間的水事糾紛，負責協調水務、海洋突發事件的應急處理；監督管理涉外海洋科學調查研究、海洋設施建造、海底工程和其他海洋開發活動。
（十三）研究制定水務和海洋發展的重大技術進步措施，組織海洋基礎與綜合調查和水務、海洋重大技術攻關；組織實施國家有關水務、海洋技術質量標準和規程、規範，承擔地方標準的起草。
（十四）承擔有關行政複議受理和行政訴訟應訴工作。
（十五）承辦市政府交辦的其他事項。
內設機構
（一）辦公室
（二）政策法規處
（三）綜合規劃處
（四）計畫財務處
（五）建設管理處（農村水利處）
（六）水資源處（市節約用水辦公室）
（七）灘涂海塘處
（八）海域海島管理處
（九）海洋環境保護處
（十）防汛和安全監督處
（十一）科技信息處
（十二）水土保持處
（十三）組織人事處
