中心主要任務是圍繞國家目標，開展模式生物技術及疾病動物模型的研究開發,承擔國家和地方科技項目，為上海乃至全國生命科學基礎研究和生物醫藥產業發展提供優質高效的遺傳工程小鼠模型研發技術服務和動物實驗環境條件及相關模型資源的保障和支撐。
中心堅持以專業技術人才為核心，以模式生物關鍵技術為龍頭的發展思路，聚集了一批學術造詣深、技術精湛的科研技術人才，建立了從基因克隆、轉基因或基因剔除質粒構建到小鼠胚胎幹細胞操作、顯微注射、遺傳育種、基因型鑑定、品系繁育、表型分析檢測、胚胎凍存等一系列遺傳工程小鼠模型研發技術，實現了從目標基因到轉基因或基因剔除小鼠模型的流水線研發模式，使模型研發能力達到每年產出100-150種各類轉基因或基因剔除小鼠模型的規模。
中心擁有國際水準的SPF級小鼠動物房，小鼠籠位數近兩萬個。配備設施先進、裝備一流的小鼠胚胎幹細胞培養室、顯微注射室和分子生物學、細胞生物學、蛋白質生化實驗室。建成了能夠進行小鼠發育生物學、行為學、病理學、血液病學、血液生化、影像學（小動物Micro CT、活體化學發光和螢光成像系統及各類螢光顯微鏡）、免疫學及內分泌代謝等指標檢測分析的小鼠表型分析技術平台（“小鼠醫院”）。
